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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003962`

染色体: Chr01 坐标: 58013013-58014871 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003962`
名称	SmilChr01G003962
描述	uncharacterized SmilChr01G003962
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58013013 - 58014871 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998321`
GeneID	`130998321`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998321`
原始查询	`SmilChr01G003962`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826007]; symbol=AT4G06536; hit=AT4G06536; species=arabidopsis; confidence=low
产物	SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826007]; symbol=AT4G06536; hit=AT4G06536; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G06536` (AT4G06536) SPla/RYanodine receptor (SPRY) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826007] identity=49; qcov=0.393; evalue=3.45e-39; confidence=low
Rice	`Os02g0614700` - identity=39.1; qcov=0.396; evalue=7.99e-33; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00622 (SPRY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998321

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779735.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057779735.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779735.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779735.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58013229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B134,B25,B81,C4,C69
`Chr1:58013267`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	A25,A7,A8,B119,B130,C24,C86
`Chr1:58013292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,C52,D8
`Chr1:58013296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B69,B7,C30,C76
`Chr1:58013297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B56,C52
`Chr1:58013322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B69,C76,C8
`Chr1:58013325`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:58013376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B33,B52,C19
`Chr1:58013378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:58013409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:58013420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:58013427`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	140	A11,A14,A15,A19,A2,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A8,A9,B101,B105,B106,B107,B109,B110,B111,B113,B115,B118,B119,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B128,B13,B131,B132,B134,B135,B137,B138,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B25,B26,B27,B30,B31,B32,B33,B39,B41,B42,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B53,B54,B56,B57,B6,B61,B63,B64,B66,B69,B71,B76,B77,B78,B8,B80,B82,B84,B85,B90,B92,B94,B96,C10,C11,C12,C15,C17,C18,C2,C21,C22,C25,C26,C27,C32,C33,C34,C35,C38,C39,C4,C41,C43,C44,C45,C49,C5,C52,C53,C54,C56,C58,C59,C6,C62,C64,C66,C69,C7,C70,C71,C73,C74,C76,C79,C8,C80,C81,C84,C87,D1,D2,D3,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779735.1

394 aa

197

394

SPRY

PF00622 SPRY 233-320 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779735.1`	Pfam	`PF00622`	SPRY	Domain	233	320	6.5e-07	30.2	SPRY domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923752.1
CATACCAGTACCATACAAATATGATTTGACTTGTTTAATAAAGTAATAAACACAAACATCATCTTCTCTTGAGTGTGTGTGTGAAGAATTTAGAGAGATGATAACTTGGATACATATCACCCTGATCTCTGGTTTTACAGTAGTAATCATCGTGCTCATTTTGATTCTAATGCGCAAGAAATGGTCACGGCCTATTACGCCTGCACAAGTGGTAATCACAGATACACAAAGCAGCCACATACAAACTAGAGAGCCCAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998321
ATGATAACTTGGATACATATCACCCTGATCTCTGGTTTTACAGTAGTAATCATCGTGCTCATTTTGATTCTAATGCGCAAGAAATGGTCACGGCCTATTACGCCTGCACAAGTGGTAATCACAGATACACAAAGCAGCCACATACAAACTAGAGAGCCCAGTTTCCGCCATCACCGACAAAGTCACCTTGTTTTCCGACAAAGGAAACCATTCTTCAGTTGGTCCGATCATCCTTGTCTTGCAGCCCACGCCGTCGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779735.1
MITWIHITLISGFTVVIIVLILILMRKKWSRPITPAQVVITDTQSSHIQTREPSFRHHRQSHLVFRQRKPFFSWSDHPCLAAHAVENGWPSFAFASTDSDHVKEAHVNVEMSWEVFDESVDYMQKIRLNNESTTSLCVIRAALPLPGPQFAHTSFPREAYFEITILSDCHRDFVSDHNAKNDLDCLNEGTNVDSKRNKIAQVKLGGKEEVEDEMVLVAIGLTGGSSYLPLKIPGSFLGSVAFNSTGSVYLDGKKLSEKEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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