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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003972`

染色体: Chr01 坐标: 58156146-58158742 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003972`
名称	SmilChr01G003972
描述	subtilisin-like protease SBT3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58156146 - 58158742 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998390`
GeneID	`130998390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998390`
原始查询	`SmilChr01G003972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	subtilisin-like protease SBT3
产物	subtilisin-like protease SBT3
Arabidopsis	`AT5G67090` (AT5G67090) Subtilisin-like serine endopeptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836844] identity=40; qcov=0.999; evalue=3.89e-176; confidence=medium
Rice	`Os05g0435800` (OsSub47) - identity=45.3; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057779794.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057779794.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779794.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779794.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58156288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:58156307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:58156397`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B10,B126,B57,B63,C43
`Chr1:58156397`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B10,B126,B57,B63,C43
`Chr1:58156507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58156531`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A25,C27,C49
`Chr1:58156531`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A25,C27,C49
`Chr1:58156609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:58156764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B88,C25
`Chr1:58156873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:58156906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B25,B88,C25
`Chr1:58156908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779794.1

755 aa

378

755

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 30-105 aa PF00082 Peptidase_S8 130-573 aa PF17766 fn3_6 644-747 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779794.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	30	105	1.4e-17	64.8	Peptidase inhibitor I9
`XP_057779794.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	130	573	8.5e-44	150.7	Subtilase family
`XP_057779794.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	644	747	6.1e-23	81.6	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923811.1
TTGAGCAAAAAGCAGAAAAAAAAATAAGCCGCCAGCTCTCACAAGTGGGTGTTTGGATAGGCTTTTTTGTTTAAAACAAATATTGATTAGTGATTACTATCAAAGAAGATCGCATTAATCTCTATAATTAGTTAAATTGCACACTGATATTTGATTGATATATACCAATCACATTCGGCTCTAGAGCGAGAGAAAAAAGAAAAAAAATGGAGCTTCATAATCCGATGGCTCTGTTTGTGCTGCTAATGCTATGGTTTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998390
ATGGAGCTTCATAATCCGATGGCTCTGTTTGTGCTGCTAATGCTATGGTTTTTCTTGGTTCATGCAGCTTCAGCCCAGAAAAGATCCACATACATTGTGCACATGGATAAACCCTCCATGCCCAAGGCATTCTCTACTCACCATTTCTGGTATTCTTCCATTCTCAAGTCTGTTAGCATCAACTCCGATCCAAAGCTTCTCTACGTTTACGACAACGCTTTCCATGGATTCAGCGTGTCCTTGTCCAAAGATGAAGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779794.1
MELHNPMALFVLLMLWFFLVHAASAQKRSTYIVHMDKPSMPKAFSTHHFWYSSILKSVSINSDPKLLYVYDNAFHGFSVSLSKDEVESLKKSPGFVSAYADAVVTPDTTHTPDFLSLNTASGLWPASEYGKDVIIGMIDTGIWPESPSFKDHGMTAVPARWKGSCRGGEEFNSSLCNKKIIGARYFNEGQRAGDSTTPVPNTARDDDGHGSHVSSIAAGNFVDGVSFFGYAPGTARGVAPRARLAVYKALWGGGGVSSDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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