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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003988`

染色体: Chr01 坐标: 58308391-58311924 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003988`
名称	SmilChr01G003988
描述	metal transporter Nramp2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58308391 - 58311924 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998502`
GeneID	`130998502`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998502`
原始查询	`SmilChr01G003988`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	metal transporter Nramp2-like
产物	metal transporter Nramp2-like
Arabidopsis	`AT1G47240` (NRAMP2) NRAMP metal ion transporter 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841127] identity=80.3; qcov=0.868; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0581600` (OsNRAMP7) - identity=71.3; qcov=0.944; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005384 (manganese ion transmembrane transporter activity); GO:0015086 (cadmium ion transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0030001 (metal ion transport)
KEGG	smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01566 (Nramp)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998502

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057779902.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057779902.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779902.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779902.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779902.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58308712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,C15,C57,D2
`Chr1:58308744`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A14,B3,B42,B80,B83,B97,C15,C6,C82
`Chr1:58308762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B6,B8,B88,C67
`Chr1:58308789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,D5
`Chr1:58308798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C20,C45,C87
`Chr1:58308833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B104,B80,C6,C9
`Chr1:58308841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:58308855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B104,B80,C6,C9
`Chr1:58308942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B104,B80,C6,C9
`Chr1:58308969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B104,B80,C6,C9
`Chr1:58308974`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58309008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779902.1

551 aa

276

551

Nramp

PF01566 Nramp 98-496 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779902.1`	Pfam	`PF01566`	Nramp	Domain	98	496	7.5e-124	414.3	Natural resistance-associated macrophage protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923919.1
AATCTATAAATTCAACAGAAGTGCCACTCGCCTTCACCGAATCCGATTTCTCTCGCACGCGCCACCGCCTGCCACCGTAGCCACTACGCCATCCAACAAAAACCCCATACGCTCAACCAAATCGATAAGTTCAACTGCAATTCGAAGAATCCAATGAACTCAACCACCTCACCTCACAACCATGCACCTCCGAATTCCCATCCACAAGCTAACCAGCTGCAAGCAGACGACCGAGACAAAGAAGATGAATCCCGCCGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998502
ATGAACTCAACCACCTCACCTCACAACCATGCACCTCCGAATTCCCATCCACAAGCTAACCAGCTGCAAGCAGACGACCGAGACAAAGAAGATGAATCCCGCCGCTTATTGCCCCTATCCGCCTCGCCGAAATCCGACGCAGTTCCGATTCAAACCGACAACGTCGACGACGAGGAGGCGGCGTACGAGGCGCGCCAGAAGATCCTGATCGCCGATTTCGAATTAGATTCGCCCAATTACTCGGGGGCGCCGCCGTTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779902.1
MNSTTSPHNHAPPNSHPQANQLQADDRDKEDESRRLLPLSASPKSDAVPIQTDNVDDEEAAYEARQKILIADFELDSPNYSGAPPFSFKKLWMFTGPGFLMSIAFLDPGNLEGDLQAGAIAGYSLLWLLMWATAMGLLIQLLSARLGVATGRHLAELCRDEYPDWARIVLWFMAEVALIGADIQEVIGSAIAIQILSRGFLPLWAGVLITAADCFIFLLLENYGVRKLEAVFAVLITTMGLSFAWMFADAKPSRKELVIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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