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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003990`

染色体: Chr01 坐标: 58320695-58323534 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003990`
名称	SmilChr01G003990
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58320695 - 58323534 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010666`
GeneID	`131010666`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010666`
原始查询	`SmilChr01G003990`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.8; qcov=0.793; evalue=4.01e-92; confidence=low
Rice	`Os12g0225300` - identity=29.4; qcov=0.84; evalue=4.61e-78; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010666

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794288.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794288.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794288.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794288.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794288.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58320704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B109,B113,B76,C9
`Chr1:58320719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:58320738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B130
`Chr1:58320754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:58320759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B99,C48
`Chr1:58320763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B113
`Chr1:58320774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B62,B63,D6
`Chr1:58320795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B132,B64,B86,C50
`Chr1:58320814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B101,B7,C26,C67
`Chr1:58320856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B55,B82,B99,C48,D7
`Chr1:58320883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:58320947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794288.1

730 aa

365

730

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 43-137 aa PF10551 MULE 259-351 aa PF04434 SWIM 546-570 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794288.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	43	137	7.8e-18	65.7	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057794288.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	259	351	9e-27	94.0	MULE transposase domain
`XP_057794288.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	546	570	0.00022	21.4	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938305.1
ATGGGGTCGTGTGATGATGTAAATAATCATGTTGATTTCTGGCGTGCTCATTCGTACCTACCAATTTGTGAGGATAGTAAGAAACCATACGTGGGTAAAGTGTTCAAGACATTGGATGAAGCGTATGAGTTTTATTCTATGTATGGACATGCAGCGGGCTTCGATACTCGTAGGGGGGGTATGAAAAGAGGCAAACATCGACAAGTATTGTATCAATACTTCATCTGCAGAAGAGAAGGTGTGAAGCCAGACTCGAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010666
ATGGGGTCGTGTGATGATGTAAATAATCATGTTGATTTCTGGCGTGCTCATTCGTACCTACCAATTTGTGAGGATAGTAAGAAACCATACGTGGGTAAAGTGTTCAAGACATTGGATGAAGCGTATGAGTTTTATTCTATGTATGGACATGCAGCGGGCTTCGATACTCGTAGGGGGGGTATGAAAAGAGGCAAACATCGACAAGTATTGTATCAATACTTCATCTGCAGAAGAGAAGGTGTGAAGCCAGACTCGAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794288.1
MGSCDDVNNHVDFWRAHSYLPICEDSKKPYVGKVFKTLDEAYEFYSMYGHAAGFDTRRGGMKRGKHRQVLYQYFICRREGVKPDSKKDISESSVQKKIRRRKPSTRNGCKARITTTLNDDGYYVFTSFSELHNHSLVTEDVRHLMKFNRKMDESHQMIMLKCAKSNIGPVRAFRIFKELVGSFEEVGCTSKDFKNLSYTMNSYVDGVDAQLLLDRFLSKRETDECFKCEYLVDETHKVKSLFWSDAVAVQNYSLFGDAVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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