当前解析结果
SmilChr01G003997| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003997 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003997 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003997 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 58373452 - 58375694 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998588 |
|---|---|
| GeneID | 130998588 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998588 |
| 原始查询 | SmilChr01G003997 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0206201; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0206201; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G01075 (AT5G01075)Glycosyl hydrolase family 35 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831885] identity=65; qcov=0.351; evalue=1.53e-11; confidence=low |
| Rice | Os03g0206201- identity=42.2; qcov=0.623; evalue=7.72e-12; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998588 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057779987.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779987.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779987.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779987.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779987.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:58374072 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B23,C53,D2 |
Chr1:58374088 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B47,B51,D1,D6 |
Chr1:58375168 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr1:58375440 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B1,B109,B24 |
Chr1:58375465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr1:58375481 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。