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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004003`

染色体: Chr01 坐标: 58430633-58431337 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004003`
名称	SmilChr01G004003
描述	uncharacterized SmilChr01G004003
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58430633 - 58431337 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010698`
GeneID	`131010698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010698`
原始查询	`SmilChr01G004003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0204200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0204200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0204200` - identity=32.6; qcov=0.564; evalue=4.49e-10; confidence=low
GO	GO:0003906 (DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006284 (base-excision repair); GO:0008081 (phosphoric diester hydrolase activity); GO:0008311 (double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057794347.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057794347.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057794347.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794347.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58430663`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:58430685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:58430822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:58430827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr1:58430834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B94,C20,C79
`Chr1:58430874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B69
`Chr1:58430886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B102,B11,B17,B18,B23,B30,B73,C47,C63
`Chr1:58430888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr1:58430903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr1:58430916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr1:58430929`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	91	A1,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A25,A3,A6,A8,B101,B104,B111,B112,B113,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B137,B138,B14,B140,B18,B26,B28,B3,B30,B37,B4,B41,B44,B49,B51,B62,B63,B66,B67,B68,B7,B70,B71,B74,B79,B8,B83,B84,B85,B86,B92,B93,B94,B97,C1,C15,C16,C20,C21,C27,C29,C30,C33,C35,C37,C4,C43,C45,C53,C57,C6,C60,C70,C71,C72,C74,C75,C76,C78,C80,C84,C87,D10,D2,D6,D8
`Chr1:58430943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B132,B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794347.1

234 aa

117

234

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 4-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794347.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	209	5.5e-12	46.6	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938364.1
ATGAAGCTCCTCTCTTTTAATGTTAGAGGTCTGGGGAGTAATGTGAAGAAAAGAGAAATTAGAGAAATTGTTCGGAAAATGGAAATAGACGTGTGTTTTGTTCAAGAAACGAAAAGAGAGATATTGGGGCTCTGGGAACTCAAGATGATTTGGGGTGGTGAGGATTTTGGGTATGCGGAGCAGAGTGCGGAAGGGAGGTCCGGAGGTATACTTACTATTTGGAACGAAAAAAAATTTGTCGCTTCGAGTCACTGGGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010698
ATGAAGCTCCTCTCTTTTAATGTTAGAGGTCTGGGGAGTAATGTGAAGAAAAGAGAAATTAGAGAAATTGTTCGGAAAATGGAAATAGACGTGTGTTTTGTTCAAGAAACGAAAAGAGAGATATTGGGGCTCTGGGAACTCAAGATGATTTGGGGTGGTGAGGATTTTGGGTATGCGGAGCAGAGTGCGGAAGGGAGGTCCGGAGGTATACTTACTATTTGGAACGAAAAAAAATTTGTCGCTTCGAGTCACTGGGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794347.1
MKLLSFNVRGLGSNVKKREIREIVRKMEIDVCFVQETKREILGLWELKMIWGGEDFGYAEQSAEGRSGGILTIWNEKKFVASSHWEIPGALIVNGFCRIGNLACCLVNVYAAQNPSEKEILWDTIGMMLGQNREACVCVAGDFNAIRAAEERSGRGLQFSPREMRVFDNFITGNALEDIRLQGRGFTWYQPQGLCKTKLDRFLVNDKWLPHLGALKSKRITKIGVGSLPNSTGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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