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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004006`

染色体: Chr01 坐标: 58443917-58449671 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004006`
名称	SmilChr01G004006
描述	uncharacterized SmilChr01G004006
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58443917 - 58449671 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998652`
GeneID	`130998652`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998652`
原始查询	`SmilChr01G004006`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0205000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0205000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G27752` (AT1G27752) Ubiquitin system component Cue protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007732] identity=48.2; qcov=0.858; evalue=4.81e-161; confidence=high
Rice	`Os03g0205000` - identity=42; qcov=1.13; evalue=6.6e-166; confidence=medium
GO	GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	-
Pfam	PF02845 (CUE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998652

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780051.1`
2	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.60000	`XP_057780051.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057780055.1`
4	P-body	P-body	0.20000	`XP_057780051.1`
5	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057780055.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58444972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:58445042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B60,B77,B98,C48,C58
`Chr1:58446747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B48,C14
`Chr1:58446748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C67
`Chr1:58447517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B48,C14
`Chr1:58448723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C15
`Chr1:58448804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr1:58448974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:58448981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C26,C8
`Chr1:58448993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr1:58449023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:58449213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780051.1

879 aa

440

879

CUE

PF02845 CUE 523-563 aa

XP_057780055.1

675 aa

338

675

CUE

PF02845 CUE 319-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780051.1`	Pfam	`PF02845`	CUE	Domain	523	563	2.6e-12	46.9	CUE domain
`XP_057780055.1`	Pfam	`PF02845`	CUE	Domain	319	359	1.8e-12	47.3	CUE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924068.1
AGTAAATGCAAAACCCTTGGGGAATTGGGGGCTGTACTTGGATTTTGGAGTGACGCATCAACGCAGACGCTCTCTTCTCTCCCCACTTCTCCCAGAAATCAATCATCCAATTCAGCTGCAAATCCCTTTTCCGAACATTCATAGACAAATTGGTGTATATATATATATACATACCTAAACACACACTCACACACACATAAGAAATTGCCGATCTTTCATTATGTCAAATCGATTCGTTAACCAGAACAAGAATGATTACA...

XM_057924072.1
CACACCGTGGAGCCCGGGAAATAGTTGCTGGAGTGATTGTTGGCGAGTTTGAGCTGTGTCGGCGAGTCTTCATGGTCTTGTACCGCTTATCATCCAACCGGGATCCTGGGACTAAGGCTGCTGACTCATTGAGTCCAAAAGATCATGAGGAAAAAGAAGTTGCTGGAGTTACCAAAACTGTTGGATATATGTGCCATATACGGTCATGAAAATGAAGAATTGTCCCAAAAACTGGTGACAAATGCAATAAAGGTTCAACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130998652
ATGTCAAATCGATTCGTTAACCAGAACAAGAATGATTACAGAACTTCAGCAAAATCCCAGAAGAAATTTGTTCCCAAGAGGGATTCCCAGAACCCTAACTCTCACCAAACCCTCTCTAACACCCTCCGCTCCACAAACACCCCTACCGGCGAAGGAGGCGATGCTGTGGCGGCGTCTGCTAGCAGAGTACGGGTGGGTGAGGATGGGTTAAGTAGAGCCTCCACGAGTGGCAATTTTGTAATTTACTTGCCCCAGGATGA...

LOC130998652
ATGAGGAAAAAGAAGTTGCTGGAGTTACCAAAACTGTTGGATATATGTGCCATATACGGTCATGAAAATGAAGAATTGTCCCAAAAACTGGTGACAAATGCAATAAAGGTTCAACCATACATCCAGGATGCTTTTCCTGTTTTGATATCGCACTTCATTAGCATTGTCCAGACCATGTATCAACGATGCAACTCAACTTTAGAGGGTTTGCTTAGTTCTGGTGGCCACCAAGACCAAGGATCCAGTCATCTTCATCTCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780051.1
MSNRFVNQNKNDYRTSAKSQKKFVPKRDSQNPNSHQTLSNTLRSTNTPTGEGGDAVAASASRVRVGEDGLSRASTSGNFVIYLPQDEAVAAGLEEGGLDPVESQRVVDLLNRELSRLLKLRPRDFWREVATDESLNAFLESFLKFRSRWYDFPHRGAREIVAGVIVGEFELCRRVFMVLYRLSSNRDPGTKAADSLSPKDHEALLQKKKLLELPKLLDICAIYGHENEELSQKLVTNAIKVQPYIQDAFPVLISHFISIV...

XP_057780055.1
MRKKKLLELPKLLDICAIYGHENEELSQKLVTNAIKVQPYIQDAFPVLISHFISIVQTMYQRCNSTLEGLLSSGGHQDQGSSHLHLDYMEVMDFINDSVVSLDSFVNAHKHAAVFFSSPVELSYGNEELLTTLARLHDSFLPSLLKGFHILSEAAEDRNKEISSDLLSNAFTSLKILSTRIAKFGWRLLYFCYLSDEAFENSYSFPVSMKMFPANVEDPVVRADIIIQTIRDLTVDHTDGPGGRTWGTFIQEIEKNHKMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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