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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004008`

染色体: Chr01 坐标: 58453702-58460395 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004008`
名称	SmilChr01G004008
描述	uncharacterized SmilChr01G004008
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58453702 - 58460395 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998662`
GeneID	`130998662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998662`
原始查询	`SmilChr01G004008`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	interferon-related developmental regulator family protein / IFRD protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839669]; symbol=SAT32; hit=AT1G27760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	interferon-related developmental regulator family protein / IFRD protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839669]; symbol=SAT32; hit=AT1G27760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G27760` (SAT32) interferon-related developmental regulator family protein / IFRD protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839669] identity=64.5; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0588000` - identity=47.7; qcov=0.984; evalue=8.56e-124; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04836 (IFRD_C); PF05004 (IFRD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780061.1`
2	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057780061.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057780061.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780061.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58454053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B67
`Chr1:58454561`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:58455255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B113,B33,B76
`Chr1:58456817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B81,C28,D9
`Chr1:58457277`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A3,B54,C55
`Chr1:58457277`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A3,B54,C55
`Chr1:58457299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,A8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780061.1

441 aa

220

441

IFRD

IFRD_C

PF05004 IFRD 22-331 aa PF04836 IFRD_C 376-428 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780061.1`	Pfam	`PF05004`	IFRD	Repeat	22	331	3.5e-88	296.2	Interferon-related developmental regulator (IFRD)
`XP_057780061.1`	Pfam	`PF04836`	IFRD_C	Family	376	428	1.2e-16	61.8	Interferon-related protein conserved region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924078.1
TAATTTTAATAAGTAACCAATTACGCTCGCTTATTTATATATATATACGTAATTGTATCCTGTTAAGAACTCTGGCAATTCGCCTCAATTTTTTTCCTCCACAGAAATTTAGCCCTACGAATTTCTCTCTCTTCCCCGTTTCCAAAATCTCCCAAATTCTTTTCATGGATACTCCCTTTCTCGATTCAATTGAGTTATTGAGTTCCCAGCTTTATTCTTATTCAATTCATCATTCTTACTTACTGGTTGCTTGTTTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998662
ATGGGTAAAAAAAGTTCTCAGAAGAAATTTGCTGCAATGCTGGATAGCGATGATACAGATAGTATGAGCTCATCCTCCTCATCTATGCGCTTGGATAATATGACAGAGAATGGTCTTGATGAAGTTCAGGTTGATAAGGATGCGATGCTTGATCAGTGCTTGGATGCTTTGTATGAGAAGAGGGGTTCCACTAGAGAAAAGGCTTTGGCATCTATTATTGAGTCCTTCAATAGCAGTTTGCAGCATGAATTTGTCGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780061.1
MGKKSSQKKFAAMLDSDDTDSMSSSSSSMRLDNMTENGLDEVQVDKDAMLDQCLDALYEKRGSTREKALASIIESFNSSLQHEFVETKFATLLQQCLNSIKKGSAKEVALASHAIGLLALTVGPGEKAQEILEESFSPISDALRVRPETSKILSLLQCLAVITFVGGEDPEQTEKSMHIMWQVAHPKLGANVATFKPSPAVIAMMVSSWSFLLTTMNGWALNPKSWQESISYFSTLLEKDDRALRMAAGEALALIFEMGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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