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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004011`

染色体: Chr01 坐标: 58522849-58524402 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004011`
名称	SmilChr01G004011
描述	probable strigolactone esterase DAD2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58522849 - 58524402 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998685`
GeneID	`130998685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998685`
原始查询	`SmilChr01G004011`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable strigolactone esterase DAD2
产物	probable strigolactone esterase DAD2
Arabidopsis	`AT3G03990` (AT3G03990) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819554] identity=78.8; qcov=0.985; evalue=3.57e-157; confidence=high
Rice	`Os03g0203200` (D14) - identity=75.3; qcov=0.981; evalue=3.12e-150; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780080.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057780080.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780080.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780080.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58523411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B46
`Chr1:58523474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B46,B68
`Chr1:58523485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:58523519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B56,B96,D11
`Chr1:58523761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:58523843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780080.1

268 aa

134

268

Abhydrolase_1

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 20-127 aa PF12697 Abhydrolase_6 21-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780080.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	20	127	2.7e-09	37.8	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057780080.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	21	258	1e-11	46.6	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924097.1
ATGTTTCCATTCGTTTTGTCTGGACCTTTGCTTTGCTTTTCTTTTATTTTGTTTTGTTTTTGATAATATACAAGTGAATGGGTCCAAAACTGGGATTATATTATAAGGTCCACATCCAAACAAATGTAACCACAAAAATTGCACATTCTAGATTCAGCTGTCTGTCAGCTATGGATAAAATTCCAAGTCAGTTTGGCACTAGTAAAATTGAAAATCTCATCCAAACAAAACCCCAGATGATTACCATACTTTGTTAGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998685
ATGGGGCACAGTCTGCTGGAGGCGTTGAACGTGCGAGTGGTGGGCTCCGGCGAGAAGATCCTCGTCCTCGCCCACGGCTTCGGCACCGATCAATCGGCGTGGCAGCGCATTCTCCCCTTCTTCCGCCACGATCACCGGATTGTGCTCTTCGATCTCGTCTGCGCCGGCACGGTCAACCCCGATTACTTTGACTTCCGCCGCTACACCACCCTCGACGCCTACGTCGACGACCTCCTCTGCATCCTCGACGCCCTCCGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780080.1
MGHSLLEALNVRVVGSGEKILVLAHGFGTDQSAWQRILPFFRHDHRIVLFDLVCAGTVNPDYFDFRRYTTLDAYVDDLLCILDALRIDRCTYVGHSVSATIGILASIKRPQLFTKLILVGFSPRFLNDHNYHGGFEQGEIEQVFSAMEANYEAWVNGFAPLAVGADVPEAVREFSRTLFNMRPDITLFVSRTVFNSDLRGVLGLVRAPCSIIQTAKDVSVPASVAAYVKNHLGGRSTVHMLNIEGHLPHLSAPNLLAQEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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