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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004013`

染色体: Chr01 坐标: 58544466-58544846 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004013`
名称	SmilChr01G004013
描述	cysteine proteinase inhibitor 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58544466 - 58544846 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010738`
GeneID	`131010738`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010738`
原始查询	`SmilChr01G004013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine proteinase inhibitor 1-like
产物	cysteine proteinase inhibitor 1-like
Arabidopsis	`AT4G16500` (AT4G16500) Cystatin/monellin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827348] identity=44.2; qcov=0.683; evalue=2.95e-13; confidence=low
Rice	`Os03g0210200` - identity=31.5; qcov=0.706; evalue=1.44e-09; confidence=low
GO	GO:0004869 (cysteine-type endopeptidase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	PF00031 (Cystatin); PF16845 (SQAPI)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010738

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057794385.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057794385.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057794385.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794385.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794385.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58544556`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B55,C23
`Chr1:58544556`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B55,C23
`Chr1:58544560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:58544608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B130
`Chr1:58544609`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:58544651`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,B10,B101,B112,B133,B22,B32,B33,B41,B56,B67,B71,B77,B95,B96,B97,C1,C12,C14,C24,C26,C34,C35,C5,C52,C73,C81
`Chr1:58544672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B128
`Chr1:58544703`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	63	A10,A2,A22,A24,A25,A3,A5,A6,A9,B101,B108,B11,B115,B120,B121,B127,B131,B135,B136,B138,B139,B20,B25,B3,B30,B37,B49,B5,B52,B54,B58,B60,B69,B77,B78,B79,B85,B88,B9,B93,B97,B98,C10,C16,C21,C23,C25,C39,C40,C42,C48,C51,C54,C56,C64,C66,C79,C80,C86,C9,D1,D10,D8
`Chr1:58544728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B74,C45,C82
`Chr1:58544737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B128,C28,C31,C78
`Chr1:58544755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:58544780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794385.1

126 aa

126

Cystatin

SQAPI

PF00031 Cystatin 39-87 aa PF16845 SQAPI 41-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794385.1`	Pfam	`PF00031`	Cystatin	Domain	39	87	7.3e-05	23.7	Cystatin domain
`XP_057794385.1`	Pfam	`PF16845`	SQAPI	Domain	41	120	8.4e-16	58.8	Aspartic acid proteinase inhibitor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938402.1
ATGGCGGTAATGGCAATGACGCTAGTTTTGAGGTTGACCGCCAGCAGCGACACATCCTCAATGGCGGTTCCCATTGTTGTCGATGCTTCACGAGGCTTCAAAGTCGACGGTTGGAAGCCGATCTCAAATTCGAACGCTCCAAAGGCGGCTGCAATTGCAAAATTCACGGTGGCGGAACACAACAAGGAGAAAAAAGAATTGTTGGTGTTTGTATTCAAGGGAACATTGCAGGTGATTGCTGGTACTAATTACAGGCTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010738
ATGGCGGTAATGGCAATGACGCTAGTTTTGAGGTTGACCGCCAGCAGCGACACATCCTCAATGGCGGTTCCCATTGTTGTCGATGCTTCACGAGGCTTCAAAGTCGACGGTTGGAAGCCGATCTCAAATTCGAACGCTCCAAAGGCGGCTGCAATTGCAAAATTCACGGTGGCGGAACACAACAAGGAGAAAAAAGAATTGTTGGTGTTTGTATTCAAGGGAACATTGCAGGTGATTGCTGGTACTAATTACAGGCTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794385.1
MAVMAMTLVLRLTASSDTSSMAVPIVVDASRGFKVDGWKPISNSNAPKAAAIAKFTVAEHNKEKKELLVFVFKGTLQVIAGTNYRLVIPTINNGATVPYKIYTIIVHSSLSQSLSLISFESNKTNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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