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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004016`

染色体: Chr01 坐标: 58558436-58559726 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004016`
名称	SmilChr01G004016
描述	uncharacterized SmilChr01G004016
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58558436 - 58559726 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998722`
GeneID	`130998722`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998722`
原始查询	`SmilChr01G004016`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828059]; symbol=AT4G03150; hit=AT4G03150; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828059]; symbol=AT4G03150; hit=AT4G03150; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G03150` (AT4G03150) plant/protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828059] identity=67.9; qcov=0.634; evalue=1.21e-48; confidence=medium
Rice	`Os12g0534100` - identity=66; qcov=0.581; evalue=1.28e-43; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31137 (DUF8822)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998722

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780117.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057780117.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780117.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780117.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780117.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58558799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:58558886`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:58559179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B73,C53,C62
`Chr1:58559227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B40,B73,C53,C62
`Chr1:58559259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr1:58559266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:58559274`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B140,B84,B94,C47
`Chr1:58559287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58559306`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C78
`Chr1:58559386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780117.1

172 aa

172

DUF8822

PF31137 DUF8822 72-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780117.1`	Pfam	`PF31137`	DUF8822	Domain	72	169	5.8e-49	165.1	Domain of unknown function (DUF8822)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924134.1
ACTATCACTTCAAAAAAGGTTTGTCATCATTAAAAATAAAAAATACTCCTAATTACAAATATGGAGTACTTGATTGTATGTGAAAGCATTTTTAGTATGCGATTAAACTATGTAATTGAAACGAGTTGTGTAAAGCATTTGGTTGTTCCAACTTCCAAGTAGGTGTAAACGACGTAGTTCGAGTCGATGAGGATATTTCGACATTTCTTATCCGAAACAAAAGCCGCTGAAACTCATCTCTCCCGCATCATAAGCCCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998722
ATGGGAATTATGCTCTTCAGTTTCCCAACAATAGTAAACCCAGTCATCAACAAAGGTGCTGACGGGATGCATAAATTCGCCAAGATTGAATCTTCAAGCAACAATCTCCAGCTCCCCCGGCGGCGGCGGCGGCAAATCGGCGCCGGAAGAAGACTTCATTGTTCGATTTCTCGGAGCAATGGCGACGAAGAACAGCTGGATTCGCCTCAAGAACTCAGGGTTCCTAGCCATTGGTTGGAGCCTTCTAGAGCCGCAGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780117.1
MGIMLFSFPTIVNPVINKGADGMHKFAKIESSSNNLQLPRRRRRQIGAGRRLHCSISRSNGDEEQLDSPQELRVPSHWLEPSRAAEESAWLRSTLQKWLDEEYCPEATNVEISKIAADSLYKSLVEKRSDLGDILLKMAVELESISYQDSFHGAFSSANAAVNLIVQRILHD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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