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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004021`

染色体: Chr01 坐标: 58606176-58610147 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004021`
名称	SmilChr01G004021
描述	tubby-like F-box protein 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58606176 - 58610147 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998781`
GeneID	`130998781`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998781`
原始查询	`SmilChr01G004021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 3
产物	tubby-like F-box protein 3
Arabidopsis	`AT2G47900` (TLP3) tubby like protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819402] identity=73.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0667000` (OsTLP7) - identity=62.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01167 (Tub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998781

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780174.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780174.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057780174.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780174.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780174.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58608561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B29,B59,C30,C74
`Chr1:58608842`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C37
`Chr1:58608842`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C37
`Chr1:58608878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,D3
`Chr1:58609464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B128,C28,C31,C78
`Chr1:58609487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B66
`Chr1:58609493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:58609501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58609521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C25
`Chr1:58609556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:58609728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780174.1

405 aa

202

405

Tub

PF01167 Tub 112-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780174.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	112	400	1.5e-106	356.5	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924191.1
TAACATCATCAGTCTCGCGGAAAAACCCAAGTCAGTAATTCATAATCATAAAGCAGCAAAAAGGGGGTTCACAACATTCACAAAAACACACACGCGCACACACTCACCAACCCTAATCTCTTCAATCTTCACTTTCACTCCAGTTTTCTTCTCACTCTATCATGTAAACTGTTCATCAAGCTCTAATTAAGCCTCAAATGGGTCTCCTGTAACCGTTTCTTTCTTGCGCGAAACCCCCTTCTGTGTAATTATTTCTGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998781
ATGTCATTAAAGAGTATACTTCAGGATATGAAGGGTGAATTTGGGAGCATATCTAGGAAGGGGTTTGAAGGGAGGTTTGGGAGGTCCAGGTCTCACCGGGTAGTCGAGGAGTCTATGGCGACTGCTGTGGATGCTCTGAGGCAGAGCTGCTGGGCGAATATGCCGCCAGAGCTCTTGAGGGACGTGCTTATGCGCATTGAGGAATCTGATTGTGATTGGCCCTCGAGGCAGAATGTTGTTGCTTGTGCTGGTGTTTGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780174.1
MSLKSILQDMKGEFGSISRKGFEGRFGRSRSHRVVEESMATAVDALRQSCWANMPPELLRDVLMRIEESDCDWPSRQNVVACAGVCRSWREIMKEIVKNLEVSGKVTFPISVKQPGPRNTLVQCFIKRNRSSQTYHLYLNYSQASNDNGKFLLAARRCRRPTYTDYIISLNAGDVSKTSSNYIGKLRSNFLGTKFTIFDAQPPNAGAKVTKSRSTRLVGMRQISPRVPAGNFPVAHISYELNVLGSRGPRRMQCVMDAIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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