当前解析结果
SmilChr01G004033| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004033 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004033 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004033 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 58763085 - 58767136 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998926 |
|---|---|
| GeneID | 130998926 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998926 |
| 原始查询 | SmilChr01G004033 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998926 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057780354.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057780354.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057780354.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780354.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780354.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:58763237 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr1:58763240 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B117,B140,B16,B53,B94 |
Chr1:58764148 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 5 | A24,B113,B126,B33,B76 |
Chr1:58764148 |
ATG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 5 | A24,B113,B126,B33,B76 |
Chr1:58764884 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B53,B94 |
Chr1:58764929 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B17 |
Chr1:58766433 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,C31 |
Chr1:58766583 |
CGT |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 52 | A20,A21,A23,A25,A4,A6,A7,B1,B106,B109,B112,B115,B120,B133,B139,B17,B20,B31,B38,B53,B56,B70,B78,B80,B85,B94,B97,B99,C10,C17,C27,C3,C35,C4,C45,C47,C48,C50,C52,C55,C58,C62,C63,C70,C73,C79,C8,C82,C86,D2,D5,D8 |
Chr1:58766586 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B53,C45 |
Chr1:58766591 |
CAA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 4 | C17,C35,C73,C82 |
Chr1:58766591 |
CAA |
C |
2bp_deletion | CDS_variant | 4 | C17,C35,C73,C82 |
Chr1:58766594 |
G |
GCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 4 | C17,C35,C73,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
6 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。