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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004036`

染色体: Chr01 坐标: 58777354-58779040 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004036`
名称	SmilChr01G004036
描述	uncharacterized SmilChr01G004036
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58777354 - 58779040 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998911`
GeneID	`130998911`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998911`
原始查询	`SmilChr01G004036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838679]; symbol=AT1G03350; hit=AT1G03350; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838679]; symbol=AT1G03350; hit=AT1G03350; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G03350` (AT1G03350) BSD domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838679] identity=41.8; qcov=1.1; evalue=1.19e-86; confidence=medium
Rice	`Os01g0273300` - identity=38.5; qcov=0.995; evalue=1.81e-62; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF03909 (BSD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998911

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780331.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780331.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057780331.1`
4	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.20000	`XP_057780331.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58777536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C48,D10
`Chr1:58777537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C53,C61,C78
`Chr1:58777650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:58777790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:58777818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:58777830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:58777832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:58777863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:58777904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B140,B84,B94,C47
`Chr1:58777915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr1:58778076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:58778086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780331.1

423 aa

212

423

BSD

PF03909 BSD 176-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780331.1`	Pfam	`PF03909`	BSD	Domain	176	232	2e-14	54.1	BSD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924348.1
AATAGTCTGCGTTCAGCTGTAGCCATCGTAGCCGGTAACAGGTAACCGTCATCTCTAAACAGCAGCGACGACTGAAATCCCAAATTCCCAAATCCCCGAAAACCGAAACCCTTCAATTCAAAAATTCACACTATGAATTTCTTCAAATCTATCATCTTAGACGATGAGGAGCCTCCAAAACCCGAGAGTCCACACGAATCCGGCCTGGAATCCGCCGTTAACCCGCCGGCCGAAGATCAGAGTCCGAATGGCACCGATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998911
ATGAATTTCTTCAAATCTATCATCTTAGACGATGAGGAGCCTCCAAAACCCGAGAGTCCACACGAATCCGGCCTGGAATCCGCCGTTAACCCGCCGGCCGAAGATCAGAGTCCGAATGGCACCGATCAGGGCGCGGACGGCGACGGATGGAGTTTCGGGAGCTTGATCAAAACCCTAGCCACCAGATCGGAATCAGTGATCGAGACTTACAGCAGAGATCTGAAGGAATTCGGCTCGGGTCTGAGGAAGGAATCCGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780331.1
MNFFKSIILDDEEPPKPESPHESGLESAVNPPAEDQSPNGTDQGADGDGWSFGSLIKTLATRSESVIETYSRDLKEFGSGLRKESEIIREAASRAVKELPASIEAGTSAAHGVLKSTAEIILQEPQFSDGESETPEINRSVNSGRYSRFEAQLSAIQSDLNTFCQEPDDLEEYEKWRSSFKLDEKSSEIEGLTGENGALDANFRKIVPNVVDHDTFWCRYFYRVDKLEQQEKFRANLVKRAISVDEDDDELSWDVDDEEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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