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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004041`

染色体: Chr01 坐标: 58823622-58827516 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004041`
名称	SmilChr01G004041
描述	elongation factor Tu, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58823622 - 58827516 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998971`
GeneID	`130998971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998971`
原始查询	`SmilChr01G004041`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	elongation factor Tu, mitochondrial-like
产物	elongation factor Tu%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT4G02930` (AT4G02930) GTP binding Elongation factor Tu family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828134] identity=78; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0851100` - identity=84.6; qcov=0.91; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003746 (translation elongation factor activity); GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0070125 (mitochondrial translational elongation)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF03143 (GTP_EFTU_D3); PF03144 (GTP_EFTU_D2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780406.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057780406.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780406.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780406.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58823796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:58823834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:58824301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr1:58825509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B140,B84,B94,C47
`Chr1:58825795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:58825916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B128
`Chr1:58825975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:58826130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:58826554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,C1,C41,C75,C87
`Chr1:58826674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780406.1

442 aa

221

442

GTP_EFTU

GTP_EFTU_D2

GTP_EFTU_D3

PF00009 GTP_EFTU 55-248 aa PF03144 GTP_EFTU_D2 272-342 aa PF03143 GTP_EFTU_D3 347-440 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780406.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	55	248	1.7e-62	211.1	Elongation factor Tu GTP binding domain
`XP_057780406.1`	Pfam	`PF03144`	GTP_EFTU_D2	Domain	272	342	7.4e-20	71.9	Elongation factor Tu domain 2
`XP_057780406.1`	Pfam	`PF03143`	GTP_EFTU_D3	Domain	347	440	1e-35	123.0	Elongation factor Tu C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924423.1
TTTTTTTCCTAAAACCCTGAGCTCGTAATAACTTTTCTATCACTCACTCTCATTTTCTCCATTCATTCTCTTCTCAAAACAAAGAAACAAATGGCGTCTGTCGCCGTACGAAATCCGATCTCTAAGCGCGCGGTCACGCTCTACTCGCTATGCTGCCGCGGAATGGCGCCGTTCCGGGACTCGGAGCCGCAGATTTCTCCGCCTCCATCTCTCAATCTTCTGCGGCGATCCATGGCCACCTTCACTCGCTCAAAACCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998971
ATGGCGTCTGTCGCCGTACGAAATCCGATCTCTAAGCGCGCGGTCACGCTCTACTCGCTATGCTGCCGCGGAATGGCGCCGTTCCGGGACTCGGAGCCGCAGATTTCTCCGCCTCCATCTCTCAATCTTCTGCGGCGATCCATGGCCACCTTCACTCGCTCAAAACCTCACATGAATATCGGGACGATTGGGCACGTCGATCATGGAAAGACGACGTTAACTGCAGCGATCACAAAGGTGTTAGCGGAAGAAGGGAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780406.1
MASVAVRNPISKRAVTLYSLCCRGMAPFRDSEPQISPPPSLNLLRRSMATFTRSKPHMNIGTIGHVDHGKTTLTAAITKVLAEEGKAKAVAFDEIDKAPEERKRGITIATAHVEYETGKRHYAHVDCPGHADYVKNMITGAAQMDGGILVVSAPDGPMPQTKEHILLARQVGVPSLVCFLNKIDAIDDPELLELVEMELRELLSFYKFPGDDIPIVRGSALAALQGTNEEIGKKAILKLMETVDAYIPDPMRQLDKPFLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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