当前解析结果
SmilChr01G004042| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004042 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004042 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004042 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 58828095 - 58831735 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998981 |
|---|---|
| GeneID | 130998981 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998981 |
| 原始查询 | SmilChr01G004042 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os05g0143300; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os05g0143300; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT4G02920 (AT4G02920)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828139] identity=31.3; qcov=0.838; evalue=2.49e-20; confidence=low |
| Rice | Os05g0143300- identity=33.7; qcov=0.91; evalue=2.24e-30; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998981 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780414.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780414.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780414.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780414.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057780414.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:58828677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr1:58828758 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
Chr1:58829787 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A3,B135,B25,B88,C25 |
Chr1:58829854 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C82 |
Chr1:58829980 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr1:58830105 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr1:58830566 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
Chr1:58831420 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。