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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004044`

染色体: Chr01 坐标: 58869926-58875331 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004044`
名称	SmilChr01G004044
描述	BTB/POZ and MATH domain-containing protein 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	58869926 - 58875331 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998995`
GeneID	`130998995`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998995`
原始查询	`SmilChr01G004044`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ and MATH domain-containing protein 2-like
产物	BTB/POZ and MATH domain-containing protein 2-like
Arabidopsis	`AT3G06190` (BPM2) BTB-POZ and MATH domain 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819793] identity=74.1; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0655300` (OsMB11) - identity=75; qcov=0.953; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF22486 (MATH_2); PF24570 (BACK_BPM_SPOP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998995

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780446.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057780446.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780446.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780446.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:58871264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C53,C61,C78
`Chr1:58871292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58871337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:58871370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C53,C61,C78
`Chr1:58871403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr1:58871460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:58871530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:58872608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:58872702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:58872714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,C53,C61,C78
`Chr1:58872739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B18,C51,C67
`Chr1:58872741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B38,B39,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780446.1

403 aa

202

403

MATH_2

BTB

BACK_BPM_SPOP

PF22486 MATH_2 32-164 aa PF00651 BTB 190-307 aa PF24570 BACK_BPM_SPOP 313-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780446.1`	Pfam	`PF22486`	MATH_2	Domain	32	164	8.7e-32	110.9	MATH domain
`XP_057780446.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	190	307	3.9e-20	72.8	BTB/POZ domain
`XP_057780446.1`	Pfam	`PF24570`	BACK_BPM_SPOP	Domain	313	367	1.9e-27	95.9	BPM/SPOP, BACK domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924463.1
TTTCACACACACACACACTCTCTCAATTGCCTCGCCTCCACCATCCACCGCCTCTCCTCCACCCTCCAGCCGCCGCTCGTATATTAAGGGGTGGCGCGGCCCCTCCCCTGACCTTCTCTCTCTACCGGAAGCCCTAGGTCCTCAATTTACAGCCTCCTCCTCGACGATTCCCGGCGACTGCACTGCCGGAAGGCCGCCGCCACCAAGCTCAGCTCTAGGTTCTCTTCCGACGCCAATCCTCTCTCTGTCCAAATCGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998995
ATGGGAAGGTTTAATCGGGAGATATCGAAACGGTCGTCTTCGTCAGAGCCGGCGGTGACGACGTCAACGTCGAGAACTGAAACCGTTAACGGTTCCCACGAGTTCAAGATCGCGGGGTACTCGTTGTCGAAGGGAATTGGGATTGGGAAGTACATAGCGTCGGATACGTTTATGGTTGGCGGGTACGATTGGGCGATTTATTTCTACCCTGATGGGAAAAGCACGGAGGACAATTCCACCTACATCTCGCTTTTCATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780446.1
MGRFNREISKRSSSSEPAVTTSTSRTETVNGSHEFKIAGYSLSKGIGIGKYIASDTFMVGGYDWAIYFYPDGKSTEDNSTYISLFIALASEGTDVRALFELTLLDQSGRERHKVHSHFSRALESGPYTLKYRGSMWGYKRFFKRTALETSDYLKDDCLQVRCCVGVVKSHTEGPKIYSIPLPPSDIGQQFGKLLKSGKGTDVNFEVDGETFSAHKLVLAGRSPVFRAQLYGPMKDHNTRCIKVEDMETPVFKALLHFIYW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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