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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004064`

染色体: Chr01 坐标: 59050577-59057861 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004064`
名称	SmilChr01G004064
描述	preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59050577 - 59057861 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999138`
GeneID	`130999138`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999138`
原始查询	`SmilChr01G004064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	preprotein translocase subunit SCY2, chloroplastic
产物	preprotein translocase subunit SCY2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G31530` (SCY2) SecY protein transport family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817711] identity=64.4; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0397700` - identity=70.8; qcov=0.8; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005048 (signal sequence receptor activity); GO:0006616 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane, translocation); GO:0008320 (transmembrane protein transporter activity); GO:0009526 (plastid envelope); GO:0009658 (chloroplast organization); GO:0010027 (thylakoid membrane organization); GO:0016020 (membrane); GO:0072598 (protein localization to chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00344 (SecY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999138

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780623.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057780623.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057780623.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780623.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59050908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B24,B4,B66,D7
`Chr1:59051283`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr1:59051304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C78
`Chr1:59051702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C32,C4,C68
`Chr1:59053181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:59054608`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C36
`Chr1:59055551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:59056915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:59057205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B76,C72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780623.1

569 aa

284

569

SecY

PF00344 SecY 200-545 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780623.1`	Pfam	`PF00344`	SecY	Family	200	545	2.8e-65	221.4	SecY

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924640.1
AATCTACGTAATTTTAATTTTTGTAGCCGTGGTAACGAAAACCGAAGATGAGAAAAATGAAATAGAAGATGAGAAAAAGGAAAAACGAAAACCCTAGCGAGCAAGTTATTTTTCGAGAGTAGCTACTCCAAAAGCATCAGATTACTCGAGCAGATAAGTAGCCAATTTCTTTTATTTCTTCCAAAGTTTGCCAGCTCCATGGAAGCCACACTTCTCAGACCTCAACCTCATTTCTACCTTCGAGGTGGGAATTCTTCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999138
ATGGAAGCCACACTTCTCAGACCTCAACCTCATTTCTACCTTCGAGGTGGGAATTCTTCGTGCAATTCCCAATTTCACAATACAAGATTATTCAGAAACCGTATATGTGCTAAACCAGTATCTTTACAATTAAGCAGAAAGCGGTTTTGTTCATCAAGAGAGCATGTATTCTTGAAAGTAAACAAAGGGTTTTCGTTATTGAGCTGTTTTGCGGATAATTCTGCAGCTGTTCGGGATGCTTCCACAGAATCAATAAATTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780623.1
MEATLLRPQPHFYLRGGNSSCNSQFHNTRLFRNRICAKPVSLQLSRKRFCSSREHVFLKVNKGFSLLSCFADNSAAVRDASTESINYEKFIDTSGSGQRAFNLNGFENSAALELKPEPFRNRFLNFVRIGTILNNALESFFKSEIRTRLFVTAVLLFVSRLGYFIPLPGFDRRLMPENYLNFLSGSTEELGNLTPELELSLFQLGLSPQIAASIVMQIACVLFPPLVKLRKEGLDANEKIKRYIWWISLGFAITQALILS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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