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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004070`

染色体: Chr01 坐标: 59114216-59116540 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004070`
名称	SmilChr01G004070
描述	cyclin-U4-1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59114216 - 59116540 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999186`
GeneID	`130999186`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999186`
原始查询	`SmilChr01G004070`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-U4-1-like
产物	cyclin-U4-1-like
Arabidopsis	`AT2G44740` (CYCP4;1) cyclin p4;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819082] identity=47.5; qcov=0.821; evalue=4.68e-60; confidence=high
Rice	`Os05g0398000` (CycU3) - identity=51.9; qcov=0.83; evalue=1.67e-64; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0019901 (protein kinase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF08613 (Cyclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999186

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780672.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780672.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780672.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780672.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780672.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59115487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C82
`Chr1:59115498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B17
`Chr1:59115510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C73,D4
`Chr1:59115835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:59116031`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B123,C44
`Chr1:59116189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:59116200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780672.1

218 aa

109

218

Cyclin

Cyclin_N

PF08613 Cyclin 47-167 aa PF00134 Cyclin_N 75-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780672.1`	Pfam	`PF08613`	Cyclin	Family	47	167	5.2e-38	131.5	Cyclin
`XP_057780672.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	75	167	9.7e-12	45.4	Cyclin, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924689.1
AAAAAGGAGAATAATAATAATATCTTCCATAATGAATCCCACCACGCTTCTCCCTCTCCTCTTTCTCTCTCTCGCATAAACACACACACTGAGCGTGAGATAGACAGGAATCCACCTTCCATGTGAAGTGTGGTATATACATAAAGAAAGAAGAGAGAGAGGGAGAGAAGAGTGACCTGAAGAGAGAGAAGAGTGACCTGAAAGACAGCCAAATTCAGAGGTGGATGTAGCATATATCTTGCTTCTTCATTGAATGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999186
ATGGGAGCTTTGTCGTTTGAACCAACGATCTTCTGCCCACTTGATTATGTGACGCTGGGGCTCAAGGACCCGATCAAGGACTACCTGGGAAAGCCCCGAGTCCTTTCACTTCTTTCATCGATTCTGGATAAAACTGTCAAGGAAAATGAGAAGATGCTAGAGACATCAGAAGCCGAAGATGTCATTACTGTGTTCCATGGTACGAGAGCGCCTTCTCTGAGCATTCAGCAATACATTGATCGGATTTTTAGGTATTCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780672.1
MGALSFEPTIFCPLDYVTLGLKDPIKDYLGKPRVLSLLSSILDKTVKENEKMLETSEAEDVITVFHGTRAPSLSIQQYIDRIFRYSNCSPSCFVIAHIYVDRFIHRTNLRLNSLNIHRLLITSVMVAAKFMDDAFFNNAYYARVGGITTRELNKLEMKFLFGVDFQLHVSVQTFKKYCSTLKQEASCGLIERSIPVCGTEDGCTSNDDDSLYSHSTSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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