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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004072`

染色体: Chr01 坐标: 59120898-59125482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004072`
名称	SmilChr01G004072
描述	DAR GTPase 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59120898 - 59125482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999211`
GeneID	`130999211`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999211`
原始查询	`SmilChr01G004072`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DAR GTPase 3, chloroplastic
产物	DAR GTPase 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G02790` (EMB3129) GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828174] identity=65; qcov=0.957; evalue=4.15e-172; confidence=high
Rice	`Os05g0430400` - identity=72.8; qcov=0.846; evalue=8.94e-171; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999211

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780698.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057780698.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057780698.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780698.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59121139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B137,B16,C58
`Chr1:59121196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B17
`Chr1:59121394`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,D7
`Chr1:59122684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B60,B98,C48
`Chr1:59122743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,B4
`Chr1:59123585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B64,C36
`Chr1:59123586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B29,B30,B4
`Chr1:59125208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C17
`Chr1:59125219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr1:59125235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B29,B4
`Chr1:59125245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B29,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780698.1

370 aa

185

370

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 214-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780698.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	214	271	1.2e-16	61.6	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924715.1
ATCTTTTAGTTAGCTAGCTCTACTCAGAACATGGGTTTGCAAGTTCCAATAAGTGATAGAGTCGAGCAAAATCGTTACATTTCAGGTGCGGTCCTATTCCTATTCTTTGAATCGAGCTGACACGTTTCTTCCCCACAGTCGAGGATAGCAAAAGCGACTTTTCTAAAAATTATCCTTTCCCAGATAATCATCGATGGCCGCTCAGCTCTCCGGCGTCTGGCTTAACAGCTCCGCCGCCTTGCTCACCGGGGAGTTACTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999211
ATGGCCGCTCAGCTCTCCGGCGTCTGGCTTAACAGCTCCGCCGCCTTGCTCACCGGGGAGTTACTCCACCGCCGGTGCAGCCGTTCTCCGTTAGCGGCGGTCTCTGCCGTTCATCCTTCCACTTCTTCGCCCATTATCCAGATTGTTGGTGGAAGAAATTTGGGATGGAATGGGATGGAGAGCTCAAAGCTCAGTAGCACTTTGGATGATGATCCTGAAGAATTTGACTGGGCAGAATTAGAACGAGACCTTTATCACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780698.1
MAAQLSGVWLNSSAALLTGELLHRRCSRSPLAAVSAVHPSTSSPIIQIVGGRNLGWNGMESSKLSSTLDDDPEEFDWAELERDLYHWTKVLRPVQWYPGHIAKTEKELKGQLKLMDVVIEVRDARIPISTSHPQMDSWLGNRKRIVVLNREDMISKADRDAWASYYARQGTKVVFSNGQFGAGTLKLTRLAKELAVGVNIKRKSRGLLPRPVRAGIVGYPNVGKSSLINRLLKRRMCPAAPRPGVTRELKWVRFGKDLEL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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