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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004081`

染色体: Chr01 坐标: 59220331-59221980 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004081`
名称	SmilChr01G004081
描述	late embryogenesis abundant protein D-34-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59220331 - 59221980 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999280`
GeneID	`130999280`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999280`
原始查询	`SmilChr01G004081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein D-34-like
产物	late embryogenesis abundant protein D-34-like
Arabidopsis	`AT3G22490` (AT3G22490) Seed maturation protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821820] identity=57.5; qcov=1.01; evalue=2.12e-86; confidence=high
Rice	`Os03g0159600` (OsLEA30) - identity=50.9; qcov=1.08; evalue=3.91e-52; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04927 (SMP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999280

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780775.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780775.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780775.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.20000	`XP_057780775.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780775.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59220790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:59220809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C53
`Chr1:59220833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B139,C53
`Chr1:59221418`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:59221487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:59221494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:59221506`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:59221537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:59221569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:59221576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:59221634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B81,C12,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780775.1

256 aa

128

256

SMP

PF04927 SMP 13-67 aa PF04927 SMP 133-190 aa PF04927 SMP 198-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780775.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	13	67	3.6e-58	194.4	Seed maturation protein
`XP_057780775.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	133	190	3.6e-58	194.4	Seed maturation protein
`XP_057780775.1`	Pfam	`PF04927`	SMP	Family	198	256	3.6e-58	194.4	Seed maturation protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924792.1
AAATAAATTATTTAAGATTGGATGTGTTATGAGTTATCCAAGAAGCAAAAGAAAAAGAAAAAATGACATTAAAGAATCTCCAAGTGTAGGTTGCTACGTCGCCGACGTGTACCCTTCATGCCAACGGAGCAGCAACCGCTTAACCACCGCGCGCCACCGCAAACTTTATTTTTCCCACCGCCGAAACTCCATTATCAAATAAACCTATATATTGTTTTGTCCGTTTCAACGTGCAAAGACAAAAATTACTGAATTTCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999280
ATGAGTCAAGGACAGCCGCAGAGGTCGCCGGAGCCCGTCAAATACGGCGACGTCTTCAACGTCTCCGGCCAACTCGCTTCGCAGCCCATCACCCCACAAGATGCCGCCACATTGCAGGCGGCCGAGACTGCCGTCTACGGCAAGACCATCAAGGGTGGTCCCGCCGCGGTCTTGCAATCAGCCGCAGACTTCAACGAGCGGTGCGGCGTGGTTGGCCACGACGACATGACCGGCGCCGTCAGAGACCGCGGCGCCACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780775.1
MSQGQPQRSPEPVKYGDVFNVSGQLASQPITPQDAATLQAAETAVYGKTIKGGPAAVLQSAADFNERCGVVGHDDMTGAVRDRGATVAEADVGGYRIVTEAVGGQVLGQYGVPLEMETDHSKSTVASGDDDAVTIGEALEATALSAGNKPVDKSDVAAIQAAEVRATGLGHVVAGGVGAEAQSAAAHNMQTTRDEEKTTLADVLTDASDKLIGDKAVTSSDAERVIYAELRNKDDPSTNPGGVAAVVAAAARLNQK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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