当前解析结果
SmilChr01G004084| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004084 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004084 |
| 描述 | FCS-Like Zinc finger 8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 59257511 - 59259753 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999304 |
|---|---|
| GeneID | 130999304 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999304 |
| 原始查询 | SmilChr01G004084 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | FCS-Like Zinc finger 8-like |
| 产物 | FCS-Like Zinc finger 8-like |
| Arabidopsis | AT3G22550 (AT3G22550)NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit, putative (DUF581) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821826] identity=39.4; qcov=1.03; evalue=1.01e-33; confidence=medium |
| Rice | Os03g0665200 (OSJNBb0031A14.9)- identity=34.5; qcov=0.853; evalue=1.03e-30; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999304 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057780803.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057780803.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780803.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780803.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057780803.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:59257898 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B128,B17 |
Chr1:59257913 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B138,C71 |
Chr1:59258352 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C51 |
Chr1:59258448 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr1:59258559 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B117,B139,B53,D11 |
Chr1:59258572 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B139,B53 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。