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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004088`

染色体: Chr01 坐标: 59287715-59289915 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004088`
名称	SmilChr01G004088
描述	vicilin Cor a 11.0101
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59287715 - 59289915 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999347`
GeneID	`130999347`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999347`
原始查询	`SmilChr01G004088`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vicilin Cor a 11.0101
产物	vicilin Cor a 11.0101
Arabidopsis	`AT3G22640` (PAP85) cupin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821835] identity=33.3; qcov=0.781; evalue=4.7e-75; confidence=low
Rice	`Os03g0793700` (OsEnS-57) - identity=36; qcov=0.764; evalue=4.53e-85; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999347

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057780858.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057780858.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780858.1`
4	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057780858.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59287806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:59287923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr1:59288007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:59288505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C74
`Chr1:59288582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B13,B131
`Chr1:59288851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:59288950`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C24
`Chr1:59288950`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C24
`Chr1:59289604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:59289659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,B64,C36
`Chr1:59289724`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B139,B53
`Chr1:59289726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B40,C42,C62,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780858.1

538 aa

269

538

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 181-293 aa PF00190 Cupin_1 335-515 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780858.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	181	293	4e-36	124.6	Cupin
`XP_057780858.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	335	515	4e-36	124.6	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924875.1
CAAAACAAAACAAATACAATCCAATGAGTTATAAAGCCAGAATCTGTTTGGTGCTGGCAGCACTGCTGCTCGCCTCCGCCACAATGGCCCTCGGATCCGAGGATCCGGAGCTGAGGCAGTGCAAGAAGAGGTGCCAAGCGCAGCACCAGTCCGACGAGAAGCAGCTGCGACAATGCGTCGCCACCTGCGAGGAACACCACCGCCACAGCGCCAACGACAGGAGCCCCATCGAGAAGCTGCGCGAGTGCAACAAAGACTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999347
ATGAGTTATAAAGCCAGAATCTGTTTGGTGCTGGCAGCACTGCTGCTCGCCTCCGCCACAATGGCCCTCGGATCCGAGGATCCGGAGCTGAGGCAGTGCAAGAAGAGGTGCCAAGCGCAGCACCAGTCCGACGAGAAGCAGCTGCGACAATGCGTCGCCACCTGCGAGGAACACCACCGCCACAGCGCCAACGACAGGAGCCCCATCGAGAAGCTGCGCGAGTGCAACAAAGACTGCGAGCACCGCCAGCAGCAGGAGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780858.1
MSYKARICLVLAALLLASATMALGSEDPELRQCKKRCQAQHQSDEKQLRQCVATCEEHHRHSANDRSPIEKLRECNKDCEHRQQQERLRADCQRRCQERYEKEVERFEERGKHGYDREREEYHGRGAGQRQSSNPYVFEDRHFFTGMQTQHGRLRILHQFTERSELLRGIENFRVAILEAQPQTFIVPKHLDADTIVFVARGRGAVSTVRQDRRESFNIKEGDIFRINAGTTTYFVNRDNNDRLILVKLIQPVNTPGHFQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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