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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004119`

染色体: Chr01 坐标: 59717132-59719622 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004119`
名称	SmilChr01G004119
描述	PHD finger protein ING2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59717132 - 59719622 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999605`
GeneID	`130999605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999605`
原始查询	`SmilChr01G004119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PHD finger protein ING2
产物	PHD finger protein ING2
Arabidopsis	`AT1G54390` (ING2) PHD finger protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841881] identity=78.5; qcov=1.01; evalue=5.53e-142; confidence=high
Rice	`Os03g0748200` - identity=67.1; qcov=0.992; evalue=5.99e-133; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0035064 (GO:0035064)
KEGG	-
Pfam	PF00628 (PHD); PF12998 (ING)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781173.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057781173.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781173.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057781173.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781173.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59717341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:59717345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:59717357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B5
`Chr1:59717357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr1:59717779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781173.1

257 aa

128

257

ING

PHD

PF12998 ING 9-118 aa PF00628 PHD 206-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781173.1`	Pfam	`PF12998`	ING	Coiled-coil	9	118	2.1e-18	67.5	Inhibitor of growth proteins N-terminal histone-binding
`XP_057781173.1`	Pfam	`PF00628`	PHD	Domain	206	252	1.4e-05	25.7	PHD-finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925190.1
AAACAATATTTTAAATTTTAATTCTGGACTGAAAAAATTGGGAGTTTGATCTGAAACGCGAAAAAGGATTCCTCTCACTTTTCCCAGTCTGCGACTCTGCGCCAAAATTCAATTTCTTTAATAAAGGAAACCCTAATTCCAAAATCGAGCTACGCCAAGAAACCCTCCAGTCCTCTGAATCTGTTGCTACGAAGTGCTCTGCCTCACTAGTTATAACCCTAGAACGATCCATTTAATCGAGCAAGCAGAAGGATGGCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999605
ATGGCGATTGCGAGAACTGGAGTTTTTGTAGACGACTATTTGGAGTATTCTAGCACATTGCCGGCGGAGCTTCAGAGGCTTCTCAACACCATTCGAGAATTGGATGATCGTTCACAAGCCATGATAAACCAATCAAGGCAGCAAACAAAGTATTGTTTGGGTTTGGCATCTCAAGGGGGTTCATTCTCTAGGAAAAACGAGGATGAGGAGGTGTCTGAAAAGCTTCGAAAAGAAATTGAGGCAAACCAGGACAATGCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781173.1
MAIARTGVFVDDYLEYSSTLPAELQRLLNTIRELDDRSQAMINQSRQQTKYCLGLASQGGSFSRKNEDEEVSEKLRKEIEANQDNALSLCTEKVLLARQAHDLIDSHIKRLDEDLNNFAEDLKQEGKIAPDEPAVLPPLPLVPKGEKRKPLYGTPQSKRFDYKERDWDRERDRDFELMPPPGSLKKDFASPVELDQPIDPNEPTYCVCHQVSFGDMIACDNENCQGGEWFHYACVGLTPETRFKGKWYCPTCRQVAH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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