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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004121`

染色体: Chr01 坐标: 59724107-59727355 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004121`
名称	SmilChr01G004121
描述	uncharacterized SmilChr01G004121
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59724107 - 59727355 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999613`
GeneID	`130999613`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999613`
原始查询	`SmilChr01G004121`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=56; qcov=0.827; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0597300` - identity=61.9; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999613

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781184.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781184.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781184.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781184.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781184.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59724390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:59724442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:59724696`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B131,B93,C44
`Chr1:59724956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B72
`Chr1:59725039`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B98,D5
`Chr1:59725218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:59725346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B128,B61,C4,D9
`Chr1:59725800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:59726131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:59726270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B5,B69,B85,C40
`Chr1:59726317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B137
`Chr1:59726352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781184.1

769 aa

384

769

DBD_Tnp_Mut

MULE

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 196-258 aa PF10551 MULE 390-485 aa PF04434 SWIM 641-669 aa

XP_057781190.1

769 aa

384

769

DBD_Tnp_Mut

MULE

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 196-258 aa PF10551 MULE 390-485 aa PF04434 SWIM 641-669 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781184.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	196	258	5.7e-27	93.9	MuDR family transposase
`XP_057781184.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	390	485	1.1e-18	68.2	MULE transposase domain
`XP_057781184.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	641	669	1.5e-09	37.9	SWIM zinc finger
`XP_057781190.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	196	258	5.7e-27	93.9	MuDR family transposase
`XP_057781190.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	390	485	1.1e-18	68.2	MULE transposase domain
`XP_057781190.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	641	669	1.5e-09	37.9	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925201.1
GGTTGACCTAAATACCCTCTCTCTAATCCCTCGCCTTTTCCACATCTCCGAATCCCCTTCCCCTCTGCCGCTGCCCCTCAAAATTTATCCTCAGCTTCCTTTGCCCTCCAATTTTTCAGATACATTGAAAGGTGAGGAAGGCTTTGAAGAGTAAGAGCTGTGCTAGCTTAGTGGTATAGCAAGTGGTGAATCAGGATCTTGTGATTGGACAATGAGATATGCCGACAGTTCAGGACTTGCACTGTGGTGTTGGGCGTGGT...

XM_057925207.1
CTAAATACCCTCTCTCTAATCCCTCGCCTTTTCCACATCTCCGAATCCCCTTCCCCTCTGCCGCTGCCCCTCAAAATTTATCCTCAGCTTCCTTTGCCCTCCAATTTTTCAGTGTTTTTGAGCGCCAGATACATTGAAAGGTGAGGAAGGCTTTGAAGAGTAAGAGCTGTGCTAGCTTAGTGGTATAGCAAGTGGTGAATCAGGATCTTGTGATTGGACAATGAGATATGCCGACAGTTCAGGACTTGCACTGTGGTGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999613
ATGCCGACAGTTCAGGACTTGCACTGTGGTGTTGGGCGTGGTCATAACTTGGCGACTGAACAGAGTTGTCCCTTAGGAACGCTGGCGGAGAACCATGACCATGATCTTGATCTGAGGGCAGTAGATGATGGTGATGTAGGTATGGGACAGGAGGATATTGGTCATAGTTATTTTTTGGCTCCGGTGATCGACCAAGAAATGTCTCTTCCACACGGTCAAGATGGAGAATATGATCACGAGTATGGTGAAGGTAGCGAGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781184.1
MPTVQDLHCGVGRGHNLATEQSCPLGTLAENHDHDLDLRAVDDGDVGMGQEDIGHSYFLAPVIDQEMSLPHGQDGEYDHEYGEGSEYENKYDPLDQKVLNDESIETRLSQEESGADNHDRRLTVASSVNELHFSEDNELGVLENCEVDENFEVMHQNTELVVVSSPLRSIVQSQVLTTSPIVQSRTVAPLPTHEFIVGQEFPDVKSCRRALRDMAIALHFEIQTVKSDKSRFTAKCASEGCPWRVHAAKLPGVPTFTIRT...

XP_057781190.1
MPTVQDLHCGVGRGHNLATEQSCPLGTLAENHDHDLDLRAVDDGDVGMGQEDIGHSYFLAPVIDQEMSLPHGQDGEYDHEYGEGSEYENKYDPLDQKVLNDESIETRLSQEESGADNHDRRLTVASSVNELHFSEDNELGVLENCEVDENFEVMHQNTELVVVSSPLRSIVQSQVLTTSPIVQSRTVAPLPTHEFIVGQEFPDVKSCRRALRDMAIALHFEIQTVKSDKSRFTAKCASEGCPWRVHAAKLPGVPTFTIRT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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