Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004123`

染色体: Chr01 坐标: 59731724-59733088 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004123`
名称	SmilChr01G004123
描述	uncharacterized SmilChr01G004123
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59731724 - 59733088 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999657`
GeneID	`130999657`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999657`
原始查询	`SmilChr01G004123`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999657

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781241.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057781249.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781241.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781241.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781241.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59731909`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C59
`Chr1:59731909`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C59
`Chr1:59731911`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:59731980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr1:59731994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:59731999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B40,C62
`Chr1:59732020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:59732646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:59732660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C59,C82
`Chr1:59732665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B19,B21,B83,C59
`Chr1:59732766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B21
`Chr1:59732766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925258.1
TTGATTGCTGAACAATGTGCAGGTGAATCAGTTGTGGTTGAGTATTTATACCTCATTATTGAGTTCTAGGAGTTTTATCGAGATCAGGTTGGCAATCTTTTGCCGTTTCAGGCTTGGAAAACAGAAGGTTGTGCCGTCAGTCGTGTAAAGCTTAAAGATAGCAAGTGCACAACTTGAGCAATTGAATGAGTTTGGACTTTGGAGTCTATTCAAGTAGCATTTGTCGAGAAACTCAGACCTTGCATAGCACGGCCTGCAGA...

XM_057925266.1
TTGATTGCTGAACAATGTGCAGGTGAATCAGTTGTGGTTGAGTATTTATACCTCATTATTGAGTTCTAGGAGTTTTATCGAGATCAGGTTGGCAATCTTTTGCCGTTTCAGGCTTGGAAAACAGAAGGTTGTGCCGTCAGTCGTGTAAAGCTTAAAGATAGCAAGTGCACAACTTGAGCAATTGAATGAGTTTGGACTTTGGAGTCTATTCAAGTAGCATTTGTCGAGAAACTCAGACCTTGCATAGCACGGCCTGCAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999657
ATGAGTTTGGACTTTGGAGTCTATTCAAGTAGCATTTGTCGAGAAACTCAGACCTTGCATAGCACGGCCTGCAGAATTCTTCTGGCAATCGCGCTCTTCCTGCATGCAACTGAGGTGAGTCGTGCATTCTGTGAGTTGAGTTTATATCTTCTCAGCAGCAACAACAAACTCGAAACTTTGCTTTGGATACGCATCGCTAGCTGCAGGAGGAGGTGGGGGAGGATACACTACTGCCCGACCAGCAAAGTTGTGCTCGGCAA...

LOC130999657
ATGAGTTTGGACTTTGGAGTCTATTCAAGTAGCATTTGTCGAGAAACTCAGACCTTGCATAGCACGGCCTGCAGAATTCTTCTGGCAATCGCGCTCTTCCTGCATGCAACTGAGTTGAGTTTATATCTTCTCAGCAGCAACAACAAACTCGAAACTTTGCTTTGGATACGCATCGCTAGCTGCAGGAGGAGGTGGGGGAGGATACACTACTGCCCGACCAGCAAAGTTGTGCTCGGCAATGCTGGTCGTGCATTTCTTTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781241.1
MSLDFGVYSSSICRETQTLHSTACRILLAIALFLHATEVSRAFCELSLYLLSSNNKLETLLWIRIASCRRRWGRIHYCPTSKVVLGNAGRAFLSAGPGWDPGAAARARW

XP_057781249.1
MSLDFGVYSSSICRETQTLHSTACRILLAIALFLHATELSLYLLSSNNKLETLLWIRIASCRRRWGRIHYCPTSKVVLGNAGRAFLSAGPGWDPGAAARARW

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器