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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004135`

染色体: Chr01 坐标: 59859439-59869965 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004135`
名称	SmilChr01G004135
描述	pre-mRNA-splicing factor SLU7-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59859439 - 59869965 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999717`
GeneID	`130999717`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999717`
原始查询	`SmilChr01G004135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-splicing factor SLU7-like
产物	pre-mRNA-splicing factor SLU7-like
Arabidopsis	`AT1G65660` (SMP1) Pre-mRNA splicing Prp18-interacting factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842877] identity=80.8; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0127700` - identity=82.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0030628 (pre-mRNA 3'-splice site binding)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF11708 (Slu7); PF30379 (SLU7_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999717

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781323.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057781323.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057781323.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781323.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781323.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59866202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C30,C64,C66,D10
`Chr1:59868029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781323.1

536 aa

268

536

SLU7_N

Slu7

PF30379 SLU7_N 92-115 aa PF11708 Slu7 136-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781323.1`	Pfam	`PF30379`	SLU7_N	Domain	92	115	9.1e-10	38.6	SLU7_N
`XP_057781323.1`	Pfam	`PF11708`	Slu7	Domain	136	405	1.8e-95	320.4	Pre-mRNA splicing Prp18-interacting factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925340.1
AGAAAAATAAAAAAAACCTTTTCTTTCCCTCTCTACAATCCACAAATTCTCATTCTTCCTGTCCCAGCTAGGGTTCGACAATTCAATCGAATTCGATCCAAATTAGCTCTGTAAACCATGGCGACTGCGTCAGTGGCGTTTAAATCAAGGGAGGATCACAGGAAACAACTTGAACTAGAAGAGGCCCGAAAGGCTGGGCTCGCACCGGCCGAAGTGGATGAAGATGGAAAGGAAATCAATCCTCACATTCCACAGTATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999717
ATGGCGACTGCGTCAGTGGCGTTTAAATCAAGGGAGGATCACAGGAAACAACTTGAACTAGAAGAGGCCCGAAAGGCTGGGCTCGCACCGGCCGAAGTGGATGAAGATGGAAAGGAAATCAATCCTCACATTCCACAGTATATGTCTTCTGCGCCTTGGTATCTCAATGCGGAGAGACCGAGTTTGAAGCATCAAAGGAAGTGGAAGTCTGATCCAAATTATACCAAGTCGTGGTATGACAGAGGTGCAAAGACTTTTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781323.1
MATASVAFKSREDHRKQLELEEARKAGLAPAEVDEDGKEINPHIPQYMSSAPWYLNAERPSLKHQRKWKSDPNYTKSWYDRGAKTFQAEKFRKGACENCGALTHDKKACVERPRKLGAKWTGKHIAPDEKIETFELDYDGKRDRWNGYDAASYKHVIQRYEARDEARSKFLKDQQLKKLEEKNNNQNKEDGVSDDEDNEDNLKVDEAKVDESKQMDFAKVEKRVRTTGGGSTGTVRNLRIREDTAKYLLNLDVNSAHYDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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