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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004137`

染色体: Chr01 坐标: 59881414-59883482 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004137`
名称	SmilChr01G004137
描述	11S globulin seed storage protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59881414 - 59883482 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999749`
GeneID	`130999749`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999749`
原始查询	`SmilChr01G004137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11S globulin seed storage protein 1-like
产物	11S globulin seed storage protein 1-like
Arabidopsis	`AT5G44120` (CRA1) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834435] identity=43.9; qcov=1.01; evalue=2.02e-128; confidence=medium
Rice	`Os01g0762500` (Glua1*) - identity=42.4; qcov=1; evalue=6.06e-128; confidence=medium
GO	GO:0045735 (nutrient reservoir activity)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999749

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057781353.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057781353.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057781353.1`
4	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057781353.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781353.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59881678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B15,B81,C12,C77
`Chr1:59881781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B62,B70,B84,C41,C52
`Chr1:59881790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:59882282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B35,D10
`Chr1:59882455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B3,C43
`Chr1:59882735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C51,D7
`Chr1:59882847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:59883060`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr1:59883060`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr1:59883062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:59883109`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C49
`Chr1:59883109`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781353.1

460 aa

230

460

Cupin_1

PF00190 Cupin_1 38-189 aa PF00190 Cupin_1 287-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781353.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	38	189	5.8e-66	221.4	Cupin
`XP_057781353.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	287	434	5.8e-66	221.4	Cupin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925370.1
GCATCATTCTCAGATAAAGAAAGCCAGATGCCTTGAGAGAAAATCATAGGTGGAAGGCATTAAAGGTGTCCTACACATGCACACTGCAAAATGGCAAACTCCCTCTCATTATGTGTCAATCCCAACCACCCACTTTCCCTCTATAAATCCCCTCCGTTTTCCCACTCAAAATTCACATCAATTTTCTGAATAAACATGGCTACAACCTTCCTCTCTGCTCTCAGCCTTGTTCTGCTCCTCGGCTCCGCCGCCGCCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999749
ATGGCTACAACCTTCCTCTCTGCTCTCAGCCTTGTTCTGCTCCTCGGCTCCGCCGCCGCCTCCGCCTATAAAGGAAGCTGGCAGCATGGCGAGTGCGATATCTCTAGGATCAACGCCATGGAGCCGTCCTTCCGCCTCCAATCCGAAGGCGGAGTGTCCGAATTCTGGGATCACAACGCCGAGGAGTTCCAGTGCGCCGGCGTGTCGTTGCACCGCCACACCATCCGCACCAGAGGCATGCTGCTGCCTGTATATCACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781353.1
MATTFLSALSLVLLLGSAAASAYKGSWQHGECDISRINAMEPSFRLQSEGGVSEFWDHNAEEFQCAGVSLHRHTIRTRGMLLPVYHNAPMLVYVLQGKGIYGITISGCPETFESPQQSREGMRSQKFGDRHQQIGFLKEGDVIAIRAGDAHWAYNNGDQDLVVVVLQDNANNANQLDQNPRSFFLAGNPNWGQEQQKEQLRFHGERRHAQHEFGNVFKGMSLDILTEAFDIDEETARKLQCDNDERGMIVIVDKELQVIK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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