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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004148`

染色体: Chr01 坐标: 60012863-60015055 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004148`
名称	SmilChr01G004148
描述	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60012863 - 60015055 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999852`
GeneID	`130999852`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999852`
原始查询	`SmilChr01G004148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein
产物	H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 3-like protein
Arabidopsis	`AT2G20490` (NOP10) nucleolar RNA-binding Nop10p family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816569] identity=82.8; qcov=1; evalue=1.17e-35; confidence=medium
Rice	`Os02g0618250` - identity=84.4; qcov=1; evalue=1.04e-35; confidence=medium
GO	GO:0031118 (rRNA pseudouridine synthesis); GO:0031120 (snRNA pseudouridine synthesis); GO:0031429 (box H/ACA snoRNP complex); GO:0034513 (box H/ACA snoRNA binding); GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:0070034 (telomerase RNA binding); GO:0090661 (box H/ACA telomerase RNP complex); GO:1904874 (positive regulation of telomerase RNA localization to Cajal body)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04135 (Nop10p)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999852

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781512.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057781512.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057781512.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781512.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60013143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:60014655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781512.1

64 aa

Nop10p

PF04135 Nop10p 3-52 aa

XP_057781521.1

64 aa

Nop10p

PF04135 Nop10p 3-52 aa

XP_057781528.1

64 aa

Nop10p

PF04135 Nop10p 3-52 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781512.1`	Pfam	`PF04135`	Nop10p	Family	3	52	4.1e-21	75.5	Nucleolar RNA-binding protein, Nop10p family
`XP_057781521.1`	Pfam	`PF04135`	Nop10p	Family	3	52	4.1e-21	75.5	Nucleolar RNA-binding protein, Nop10p family
`XP_057781528.1`	Pfam	`PF04135`	Nop10p	Family	3	52	4.1e-21	75.5	Nucleolar RNA-binding protein, Nop10p family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925529.1
TTGGTCGTACGGATCGGATATTAATCGGAACAAATGGGCTGCTACCTATTTTACCCAAGCCAAGGGGTTTATATTGTCAAACCCTAATTGCTAAAGCCTCGCGTTTTGTAGGTACATATTTCGGAACCCTAATTGCCAGAACCTCCCATTTTCTGAAGATTAAGGTGGTTTTGAGCGCGTATTGTGTATAGCTGAAGATGTATCTCCAATTTTACATCAACGATAACGGTGACAAAGTTTACACTACCAAGAAGGAGTCA...

XM_057925545.1
TGCTAAAGCCTCGCGTTTTGTAGATTAAGGTGGTTTTGAGCGCGTATTGTGTATAGCTGAAGATGTATCTCCAATTTTACATCAACGATAACGGTGACAAAGTTTACACTACCAAGAAGGAGTCACCTGTAGGTTTGGCAACGGAATCAGCTCATCCTGCCCGATTCTCTCCCGATGATAAATACTCAAGGCAGAGAATTCTTCTGAAGAAGCGCTTTGGTCTGCTTCCAACCCAACACCCGCCTCCAAAGTACTGAATT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130999852
ATGTATCTCCAATTTTACATCAACGATAACGGTGACAAAGTTTACACTACCAAGAAGGAGTCACCTGTAGGTTTGGCAACGGAATCAGCTCATCCTGCCCGATTCTCTCCCGATGATAAATACTCAAGGCAGAGAATTCTTCTGAAGAAGCGCTTTGGTCTGCTTCCAACCCAACACCCGCCTCCAAAGTACTGA

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057781512.1
MYLQFYINDNGDKVYTTKKESPVGLATESAHPARFSPDDKYSRQRILLKKRFGLLPTQHPPPKY

XP_057781521.1
MYLQFYINDNGDKVYTTKKESPVGLATESAHPARFSPDDKYSRQRILLKKRFGLLPTQHPPPKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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