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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004152`

染色体: Chr01 坐标: 60045751-60050588 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004152`
名称	SmilChr01G004152
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60045751 - 60050588 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999885`
GeneID	`130999885`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999885`
原始查询	`SmilChr01G004152`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 3-like
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 3-like
Arabidopsis	`AT1G03950` (VPS2.3) vacuolar protein sorting-associated protein 2.3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839362] identity=80.5; qcov=0.991; evalue=2.46e-121; confidence=high
Rice	`Os10g0476400` - identity=75.9; qcov=1; evalue=5.42e-116; confidence=high
GO	GO:0000815 (ESCRT III complex); GO:0005771 (multivesicular body); GO:0015031 (protein transport); GO:0032509 (endosome transport via multivesicular body sorting pathway); GO:0045324 (late endosome to vacuole transport)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03357 (Snf7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999885

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781562.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781562.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057781562.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057781562.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057781562.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60048158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:60048863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B62,B70,C41,C52
`Chr1:60048863`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B62,B70,C41,C52
`Chr1:60048907`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr1:60048907`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr1:60048909`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr1:60048909`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr1:60049364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B56,B96,C33,C48
`Chr1:60049649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781562.1

212 aa

106

212

Snf7

PF03357 Snf7 16-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781562.1`	Pfam	`PF03357`	Snf7	Family	16	185	1.7e-39	136.0	Snf7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093613.1
TGTTGACATTATAATTCATAGTGAAAAAACATTACTCCTACTATTTATTTATATAGCGCAAAGTTACAGAGACGCACATGGAAGCAGACTTGATATACTAATCATTAAACACACACACGCTGTAATTTGTGGCGCGATCATATCTTCCATTTACAGAATTTCCCCTACTCCGACCGAATCAAACATGAGCATCTTCTCCAAGAAACCTACAGCCAAAGAGGCTCTTCGGGAGAGCAAGCGGGAGATGGCCAATGCAACCA...

XM_057925579.1
TGGTGGTTCTTGAGACCAACCTAACGAGTTTGTTGACATTATAATTCATAGTGAAAAAACATTACTCCTACTATTTATTTATATAGCGCAAAGTTACAGAGACGCACATGGAAGCAGACTTGATATACTAATCATTAAACACACACACGCTGTAATTTGTGGCGCGATCATATCTTCCATTTACAGAATTTCCCCTACTCCGACCGAATCAAACATGAGCATCTTCTCCAAGAAACCTACAGCCAAAGAGGCTCTTCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999885
ATGAGCATCTTCTCCAAGAAACCTACAGCCAAAGAGGCTCTTCGGGAGAGCAAGCGGGAGATGGCCAATGCAACCAGAGGTGTAGAGAGGGAAATTCAGACGCTGCAATCGGAGGAAAAGAAGCTTGTCACTGAGATAAAAAGAACTGCTAAAACAGGGAATGAGGCCGCTACCAAAATTCTTGCACGTCAATTGATCAGGCTTCGGCAACAGATAGCCAAATTACAAGGTAGTCGAGCTCAGATGAGAGGTATAGCAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781562.1
MSIFSKKPTAKEALRESKREMANATRGVEREIQTLQSEEKKLVTEIKRTAKTGNEAATKILARQLIRLRQQIAKLQGSRAQMRGIATHTQAMSAQTSVAVGMKGASKAMAAMNKQMAPAKQMKAIQEFQKQSAQMDMTTEMMSDAIDDALDDDEAEDETEELTNQVLDEIGVDVASQLSAAPKGKIAGRNTEDAGSSRMDELEKRLAALRNP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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