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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004153`

染色体: Chr01 坐标: 60051287-60053274 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004153`
名称	SmilChr01G004153
描述	60S ribosomal protein L14-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60051287 - 60053274 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999898`
GeneID	`130999898`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999898`
原始查询	`SmilChr01G004153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L14-2-like
产物	60S ribosomal protein L14-2-like
Arabidopsis	`AT4G27090` (AT4G27090) Ribosomal protein L14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828817] identity=85.8; qcov=1; evalue=6.85e-79; confidence=high
Rice	`Os04g0515300` - identity=85.1; qcov=1; evalue=4.03e-82; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01929 (Ribosomal_L14e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999898

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781576.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057781585.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057781576.1`
4	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057781585.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60051521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:60051953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B56,B96,C33,C48
`Chr1:60051958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B16
`Chr1:60052123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:60052204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781576.1

138 aa

138

Ribosomal_L14e

PF01929 Ribosomal_L14e 45-116 aa

XP_057781585.1

134 aa

134

Ribosomal_L14e

PF01929 Ribosomal_L14e 45-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781576.1`	Pfam	`PF01929`	Ribosomal_L14e	Family	45	116	2e-26	93.0	Ribosomal protein L14
`XP_057781585.1`	Pfam	`PF01929`	Ribosomal_L14e	Family	45	117	1.5e-26	93.4	Ribosomal protein L14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925593.1
AAGCCAGAAATTGAGAAGGGCCCAAAGCCCAAAACCATGAAAACAAAAACCCTAGCGCATTAGCTATATCCCAATCGAACCCTTTGCACCCTTACATTTGCTACCTCCGCCTCTGCTCTAACATCACAGCACACACATTCACTTCTCTGCAGCAGAAAATGCCGTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGGGTGGCCCTCGTCAACTACGGAAAAGACTACGGAAAGCTTGTCGTCATCGTCGATGTTATCGACCAGAAC...

XM_057925602.1
AGCCAGAAATTGAGAAGGGCCCAAAGCCCAAAACCATGAAAACAAAAACCCTAGCGCATTAGCTATATCCCAATCGAACCCTTTGCACCCTTACATTTGCTACCTCCGCCTCTGCTCTAACATCACAGCACACACATTCACTTCTCTGCAGCAGAAAATGCCGTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGGGTGGCCCTCGTCAACTACGGAAAAGACTACGGAAAGCTTGTCGTCATCGTCGATGTTATCGACCAGAACA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999898
ATGCCGTTCAAGAGGTACGTCGAGATCGGGAGGGTGGCCCTCGTCAACTACGGAAAAGACTACGGAAAGCTTGTCGTCATCGTCGATGTTATCGACCAGAACAGGGCTCTTGTTGACTCACCTGACATGGTAAGAAGCCAGATGAATTTCAAGAGGCTTTCTCTTACAGACATCAAAATTGACATCAAGAGGGTGCCGAAGAAGAAGACTCTTGTTGCTGCTATGGAGGCTGCTGATGTTAAGGGAAAATGGGAAAGCAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781576.1
MPFKRYVEIGRVALVNYGKDYGKLVVIVDVIDQNRALVDSPDMVRSQMNFKRLSLTDIKIDIKRVPKKKTLVAAMEAADVKGKWESSSWGRKLIVQKRRAALNDFDRFKLMLAKIKVTAAYNICYSCMLPEFVQQITI

XP_057781585.1
MPFKRYVEIGRVALVNYGKDYGKLVVIVDVIDQNRALVDSPDMVRSQMNFKRLSLTDIKIDIKRVPKKKTLVAAMEAADVKGKWESSSWGRKLIVQKRRAALNDFDRFKLMLAKIKKAGVVRQELAKLKKETAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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