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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004159`

染色体: Chr01 坐标: 60080427-60082854 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004159`
名称	SmilChr01G004159
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60080427 - 60082854 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999937`
GeneID	`130999937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999937`
原始查询	`SmilChr01G004159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2-like
产物	protein NRT1/ PTR FAMILY 5.2-like
Arabidopsis	`AT5G46050` (PTR3) peptide transporter 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834646] identity=60.8; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0470700` (OsPTR3) - identity=64.6; qcov=0.975; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0042937 (tripeptide transmembrane transporter activity); GO:0042938 (dipeptide transport); GO:0055085 (transmembrane transport); GO:0071916 (dipeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00854 (PTR2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781629.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781629.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781629.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781629.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781629.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60080861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C51,C67
`Chr1:60080948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:60081102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C51,C67
`Chr1:60081254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:60081282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:60081341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:60081479`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C51,C67
`Chr1:60081643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,A21,B126
`Chr1:60081645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,A21,B126
`Chr1:60081698`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B16,B17,C76
`Chr1:60081795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47
`Chr1:60081828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781629.1

594 aa

297

594

PTR2

PF00854 PTR2 103-526 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781629.1`	Pfam	`PF00854`	PTR2	Family	103	526	8.1e-105	351.6	POT family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925646.1
GAATATGACATGCATATATATACAATTAAGCCTAGCTAGTTATTTTGCAAACACTCTTCTCTCTCTCTCTGATCATGTCGACGATGAAGGTGGAAGAGGGAGGAGATGGGGGTTATACACAAGATGGCACCTTCGACCTCAAAGGTAGACCAGTTCTTAGATCAACCACTGGAAAATGGAAGGCTTGCTACTTCATTGTTGGGTATGAAGCAATTGAGAGGATGGCTTACTATGGGATTGCATCAAATCTAGTGATATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999937
ATGTCGACGATGAAGGTGGAAGAGGGAGGAGATGGGGGTTATACACAAGATGGCACCTTCGACCTCAAAGGTAGACCAGTTCTTAGATCAACCACTGGAAAATGGAAGGCTTGCTACTTCATTGTTGGGTATGAAGCAATTGAGAGGATGGCTTACTATGGGATTGCATCAAATCTAGTGATATATCTGACAACAAAGCTCCATGAAGGCACTGTGGAATCCGCAAACAATGTGACTAATTGGATTGGCACAGTTTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781629.1
MSTMKVEEGGDGGYTQDGTFDLKGRPVLRSTTGKWKACYFIVGYEAIERMAYYGIASNLVIYLTTKLHEGTVESANNVTNWIGTVWMTPLIGAYIADTYLGRYWTFMIASCIYLMGMVLLTLVVSLSALRPPPCGDGVMEKDCDKKASTFQIGIFYLALYIIAIGTGGTKPNISTMGADQFDDYEPQEKFQKLSFFNWWMFSIFLGTLFSNTFLVYIQDNVGWAVGYALPTVGLAVSILVFIVGTRYYRHKPPSGSPLTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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