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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004167`

染色体: Chr01 坐标: 60180378-60182101 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004167`
名称	SmilChr01G004167
描述	60S ribosomal protein L23-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60180378 - 60182101 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000145`
GeneID	`131000145`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000145`
原始查询	`SmilChr01G004167`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L23-like
产物	60S ribosomal protein L23-like
Arabidopsis	`AT2G33370` (AT2G33370) Ribosomal protein L14p/L23e family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817900] identity=98.6; qcov=1; evalue=1.09e-98; confidence=high
Rice	`Os03g0139100` - identity=98.6; qcov=1; evalue=6.51e-99; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit); GO:0070180 (large ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00238 (Ribosomal_L14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000145

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781909.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057781909.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781909.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781909.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781909.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60180560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B2,C12,C65
`Chr1:60180603`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A8,B2,C12,C65
`Chr1:60180603`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A8,B2,C12,C65
`Chr1:60181756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:60181874`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	89	A10,A15,A16,A2,A21,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B104,B105,B106,B109,B121,B126,B129,B13,B133,B135,B136,B137,B138,B15,B16,B17,B26,B27,B29,B3,B30,B35,B37,B38,B39,B4,B48,B54,B57,B58,B60,B63,B7,B70,B75,B77,B79,B81,B83,B84,B86,B9,B98,C12,C17,C18,C19,C22,C27,C37,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C51,C59,C6,C64,C66,C70,C71,C75,C76,C78,C79,C80,C9,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D8
`Chr1:60181876`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	87	A10,A15,A16,A2,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B104,B105,B106,B121,B126,B129,B13,B133,B135,B136,B137,B138,B15,B16,B17,B26,B27,B29,B3,B30,B35,B37,B38,B39,B4,B48,B54,B57,B58,B60,B63,B7,B70,B75,B77,B79,B81,B83,B84,B86,B9,B98,C12,C17,C18,C19,C22,C27,C37,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C51,C59,C6,C64,C66,C70,C71,C75,C76,C77,C78,C79,C80,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781909.1

140 aa

140

Ribosomal_L14

PF00238 Ribosomal_L14 21-140 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781909.1`	Pfam	`PF00238`	Ribosomal_L14	Domain	21	140	6.7e-42	142.9	Ribosomal protein L14p/L23e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925926.1
GGTTTAGACGCGAAAATGTCGAAGCGAGGACGCGGAGGAACGGCGGGTAATAAGTTCAGGATGTCGCTGGGTCTGCCGGTGGCGGCGACGGTGAACTGTGCCGACAACACCGGCGCGAAGAACCTGTACATTATATCAGTGAAGGGAATCAAGGGTCGCCTCAACAGGCTCCCGTCTGCCTGCGTCGGCGACATGGTCATGGCCACCGTTAAGAAGGGGAAACCTGATCTACGTAAGAAGGTCATGCCCGCCGTCATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000145
ATGTCGAAGCGAGGACGCGGAGGAACGGCGGGTAATAAGTTCAGGATGTCGCTGGGTCTGCCGGTGGCGGCGACGGTGAACTGTGCCGACAACACCGGCGCGAAGAACCTGTACATTATATCAGTGAAGGGAATCAAGGGTCGCCTCAACAGGCTCCCGTCTGCCTGCGTCGGCGACATGGTCATGGCCACCGTTAAGAAGGGGAAACCTGATCTACGTAAGAAGGTCATGCCCGCCGTCATCGTCCGCCAGCGCAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781909.1
MSKRGRGGTAGNKFRMSLGLPVAATVNCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPSACVGDMVMATVKKGKPDLRKKVMPAVIVRQRKPWRRKDGVFMYFEDNAGVIVNPKGEMKGSAITGPIGKECADLWPRIASAANAIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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