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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004171`

染色体: Chr01 坐标: 60196278-60197701 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004171`
名称	SmilChr01G004171
描述	plasmodesmata-located protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60196278 - 60197701 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000103`
GeneID	`131000103`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000103`
原始查询	`SmilChr01G004171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plasmodesmata-located protein 3-like
产物	plasmodesmata-located protein 3-like
Arabidopsis	`AT2G33330` (PDLP3) plasmodesmata-located protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817896] identity=47.6; qcov=1; evalue=5.95e-81; confidence=high
Rice	`Os03g0140500` - identity=45.8; qcov=0.934; evalue=1.65e-60; confidence=high
GO	GO:0009506 (plasmodesma); GO:0010497 (plasmodesmata-mediated intercellular transport); GO:0046739 (transport of virus in multicellular host)
KEGG	-
Pfam	PF01657 (Stress-antifung)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000103

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781857.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057781857.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781857.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781857.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781857.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60196543`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D1
`Chr1:60196543`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D1
`Chr1:60196645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A13,A18,A2,A21,A24,B11,B111,B115,B140,B21,B27,B35,B36,B48,B6,B62,B65,B67,B74,B8,B88,B93,C1,C10,C12,C13,C14,C20,C44,C45,C46,C47,C5,C56,C65,C66,C74,C80,C84,D3,D7,D8
`Chr1:60196714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A2,A21,B21,B65,B74,B93,C12,C44,C45,C47,C65,D3,D7,D8
`Chr1:60196743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:60196866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C51,C67
`Chr1:60196898`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C28
`Chr1:60196898`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C28
`Chr1:60196965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:60197013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B17,B54,B77,D4
`Chr1:60197020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:60197053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D11,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781857.1

290 aa

145

290

Stress-antifung

PF01657 Stress-antifung 35-127 aa PF01657 Stress-antifung 176-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781857.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	35	127	1.3e-27	97.0	Salt stress response/antifungal
`XP_057781857.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	176	227	1.3e-27	97.0	Salt stress response/antifungal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925874.1
TAAACTTTGCCAACTGCGAAGCTGGCAGAGCGAAAAGAGCACACACTCCACACTCTTCTGCCTCCCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCACACACACCAAATTGCAAATTGTTGCTCGTAGCCAAGATTATGAACTCAACGAACTCTAGAAACACCCAAAAAACCAGAGGCCCCTTTCGAATCCTCCCCTAACAAATCATTATAACATGTAATCGAGTTAAAAAAACAAAACCATTTTGAAAGAAATTCCGAAATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000103
ATGGGTCCATCTCAATCCGCTCCAATCATTTTCTCGCTCATCCTCTCTCTCTCCTCCATCCTGGCCTCCTCCTCCGACTACACCAACCTCGTTTTCAAAGGCTGTGCAGACCAGAAATTCCCCGACTCCAACCCCCTCTACAAGCAAACCCTCAAAACCCTCGCCGCCGACCTCACCTCCCGATCCTCCGCCGCCAACTTCTACAAAACCTCCTCCGGCGACGGCGCCTCCGCCATGAGCGGCCTCTACCAATGCCGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781857.1
MGPSQSAPIIFSLILSLSSILASSSDYTNLVFKGCADQKFPDSNPLYKQTLKTLAADLTSRSSAANFYKTSSGDGASAMSGLYQCRGDLSGGACSGCVAKATSMAGKLCGAAVAARVQLGGCYIRYEIAGFRQASATELVYKVCGSTRPGLGDRLDAALGGIAKGVASGRFYAGGYESVYVLGQCEGDLTSGDCVNCVKMAAERAKSECGSSISAQIYLLECYISYTYYPNGAPTNHHSSSISSSGREKNTQKTVAIVIG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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