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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004180`

染色体: Chr01 坐标: 60242014-60252728 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004180`
名称	SmilChr01G004180
描述	uncharacterized SmilChr01G004180
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60242014 - 60252728 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000015`
GeneID	`131000015`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000015`
原始查询	`SmilChr01G004180`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DENN (AEX-3) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816551]; symbol=AT2G20320; hit=AT2G20320; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DENN (AEX-3) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816551]; symbol=AT2G20320; hit=AT2G20320; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G20320` (AT2G20320) DENN (AEX-3) domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816551] identity=51.6; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0145500` - identity=49.9; qcov=0.956; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02141 (DENN); PF03456 (uDENN)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000015

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057781728.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057781728.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781728.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.40000	`XP_057781728.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057781728.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60243192`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B35,C40
`Chr1:60243245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr1:60245082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:60245125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,C51,C72,D11
`Chr1:60247318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,B84
`Chr1:60248010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B72,C79
`Chr1:60248234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:60248282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B21,B72,C79
`Chr1:60248657`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:60250875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B35,B5,C40
`Chr1:60250911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B105,B112,B75,C3
`Chr1:60251540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781728.1

804 aa

402

804

uDENN

DENN

PF03456 uDENN 189-267 aa PF02141 DENN 570-674 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781728.1`	Pfam	`PF03456`	uDENN	Domain	189	267	4.5e-06	27.8	uDENN domain
`XP_057781728.1`	Pfam	`PF02141`	DENN	Family	570	674	1.6e-28	100.5	DENN (AEX-3) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093642.1
ATTATTTTATTTTCTTGCAAATATTTGACGATGAAACGTTGATGCTGTTCAGTTTTAGGCAATTCTGCATTTCGCATAAACAACCTCCGTCTGCATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACACCCACCCACCTCACACACTAACATCAAATAATATATGCAGAAAGAAACCGTTATTCAGGAACCGAAATCCTCAGAGAGAAAAATAATAAGGATCAAAATCCTCCAAAAAGGGAAATCAATGCACATCTAATTATG...

XM_057925745.1
ATTATTTTATTTTCTTGCAAATATTTGACGATGAAACGTTGATGCTGTTCAGTTTTAGGCAATTCTGCATTTCGCATAAACAACCTCCGTCTGCATGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACGCACACACCCACCCACCTCACACACTAACATCAAATAATATATGCAGAAAGAAACCGTTATTCAGGAACCGAAATCCTCAGAGAGAAAAATAATAAGGATCAAAATCCTCCAAAAAGGGAAATCAATGCACATCTAATTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000015
ATGGGGACAAAAGAAAATGATGATGCTCAGGAAGACTGGTCTGAACCACCATCACCAATTGAGGTGTTGCAGCAGTTGTCCAAGGAGGCAGTTAGAATGGCAGGTGAGGCATGGCATCATGCCTATCCAAGTAGTACTCCAAATTTGGAGTCAGTACCAAGGCATAGGCGTGCGCGAAGTGAAATAGTCACTTCAAGTCATAATCCCAGCGGTAGCACCAGTAATTTCCAAAGACTGAAGGGTCATATGCAAAGGGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781728.1
MGTKENDDAQEDWSEPPSPIEVLQQLSKEAVRMAGEAWHHAYPSSTPNLESVPRHRRARSEIVTSSHNPSGSTSNFQRLKGHMQRALHLGGRCSRDDSQYSSFDPEILANQKRQWYQLNSKTLGTDIYQEPTSLFEHFVVVGLQPDTKLEFVEDAYIRGKKFEKQMKKIEASEFSMRPLRPPKFPMMEPQVLFMYPPRKKLDLQLQDLAAFCFPAGVKARVLERSPSLSELNELVYGQEHLTRDDFSFIFSLKVAGNATL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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