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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004182`

染色体: Chr01 坐标: 60257728-60266584 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004182`
名称	SmilChr01G004182
描述	WD repeat-containing protein WDS homolog
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60257728 - 60266584 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000040`
GeneID	`131000040`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000040`
原始查询	`SmilChr01G004182`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD repeat-containing protein WDS homolog
产物	WD repeat-containing protein WDS homolog
Arabidopsis	`AT5G43920` (AT5G43920) transducin family protein / WD-40 repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834414] identity=62.3; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0294600` (OsWD40-41) - identity=46.3; qcov=0.88; evalue=1.2e-145; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40); PF23627 (LisH_WDR26)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000040

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781766.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781766.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781766.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781766.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781766.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60258567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:60258606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr1:60258736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr1:60258982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr1:60263135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B40,B84,C3,C62
`Chr1:60265044`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:60265130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B6,B65,C42,C87
`Chr1:60265131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:60265155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:60265241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr1:60265356`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B40,B84,C3,C62
`Chr1:60265521`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B133,B29,B4,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781766.1

527 aa

264

527

LisH_WDR26

WD40

PF23627 LisH_WDR26 9-52 aa PF00400 WD40 218-252 aa PF00400 WD40 262-297 aa PF00400 WD40 302-333 aa PF00400 WD40 433-470 aa PF00400 WD40 475-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781766.1`	Pfam	`PF23627`	LisH_WDR26	Domain	9	52	1.8e-22	79.1	WDR26 Lis-homology domain
`XP_057781766.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	218	252	6.3e-42	140.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781766.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	262	297	6.3e-42	140.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781766.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	302	333	6.3e-42	140.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781766.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	433	470	6.3e-42	140.9	WD domain, G-beta repeat
`XP_057781766.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	475	512	6.3e-42	140.9	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925783.1
TTTATAATCAAAAATAATAAATTAAATTGCTAGAAAAAAGAAGAAGAAGATTTTGCTAGTTGAGAAAAACCTCGAAAATTCAAACAAAATGCGTCGATTGGAATCATTTGGATAACAGCAGCTCGCTCCTTTACTCCTCAGTCGTCTACATCACCATCATTTATCCCCCATTTGATTTTTGCGAGTTTCGATCAAACCCTAATATTGCTGCCCGAATTGTACCATCAGTCGCTTCGAACAACTATGGAAGGTGGCTAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000040
ATGGAGACAACGGATGACATAGGAGATGTGATTGGTCCAAGAGGCCTGATTAAGAAGCACGAGTTGGTACGAATCATCATTCAATGTTTATACGCTCTAGGTTACAGCAAGTCCGCTGCCTGTTTGGAATCTGAGTCTGGCATTACATGTAAGTCCCCCGAATTTGAATTAATCGAATCACACATTTTAGATGGAAATTGGGATGATTGCATCGAGAGTCTTGACAAAATAAATGGCTTGGATGACGAGACAAGGGCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781766.1
METTDDIGDVIGPRGLIKKHELVRIIIQCLYALGYSKSAACLESESGITCKSPEFELIESHILDGNWDDCIESLDKINGLDDETRASVSFLVLEQCLLECLDCGNISLALDIMRKQFSSLKIGTEMVHKLSYELLSLKGLRLGCIDSDSVHELRKRLLANLEKVLPPPITLPERRLEHLVEMAISALVDDCIYHSSSDSVSLYRDHHCDRDQFPTETTQILTNHQNEVWSVQFSNNGEYLASSSSDCTAIIWKVQDDNRV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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