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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004191`

染色体: Chr01 坐标: 60368766-60370470 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004191`
名称	SmilChr01G004191
描述	photosystem I reaction center subunit IV A, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60368766 - 60370470 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000234`
GeneID	`131000234`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000234`
原始查询	`SmilChr01G004191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem I reaction center subunit IV A, chloroplastic-like
产物	photosystem I reaction center subunit IV A%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G20260` (PSAE-2) photosystem I subunit E-2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816545] identity=56.9; qcov=1.04; evalue=5.41e-40; confidence=medium
Rice	`Os07g0435300` (PsaE) - identity=75.4; qcov=0.5; evalue=2.51e-35; confidence=medium
GO	GO:0009522 (photosystem I); GO:0009538 (photosystem I reaction center); GO:0015979 (photosynthesis)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02427 (PSI_PsaE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000234

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057782017.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057782017.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782017.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782017.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782017.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60368946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr1:60370001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B55,B72,C16
`Chr1:60370016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B5,B53,C43
`Chr1:60370122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B105,B112,B75
`Chr1:60370168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,D4
`Chr1:60370191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782017.1

138 aa

138

PSI_PsaE

PF02427 PSI_PsaE 79-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782017.1`	Pfam	`PF02427`	PSI_PsaE	Domain	79	136	2e-29	101.8	Photosystem I reaction centre subunit IV / PsaE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926034.1
AAATGCAAGTAAGATCACATTATCCAAACGAAATGGATAAGACATTACGTGGCACAACCCGAGTGGCTGAATCCAATAACTTAGATCTTCACAGAATTCATAGTCCATGAAAATACGATAATCGGATTTATTGAGATAATTTCAAATAATCCTCATTTACTCTCTTGAATTTGATTCTCATTTACATTTCAAGAGAAAATCTCGTCATAAAAATAATCCAAGAAAAAAATTTAAATTAAATGGCAAGCTGCAGTATGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000234
ATGGCAAGCTGCAGTATGGCATCATGTGGATTTGTGGTGACACCTAATGTGATCTCTTCCGCCGCAACCACCCCCAAAGCCACCGTGCTCTTCTTCCCTTCCAAGAAAACCGGCGGCTCACGGCTGGTGGTCCGCGCCGGCGATGAGGCCGCCGCTGCAGCACCAGCGGCTGCCACCGCTACGCCACCGGCTGAAGCTCCTAAAGCGGCCAAGCCGCCGCCAATTGGCCCCCCCAGAGGCTCAAAGGTGAGAGTTCTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782017.1
MASCSMASCGFVVTPNVISSAATTPKATVLFFPSKKTGGSRLVVRAGDEAAAAAPAAATATPPAEAPKAAKPPPIGPPRGSKVRVLRKESYWFKGVGSVVAVDQDPKSRYPVVVRFNKVNYANVSTNNYALDEVEVIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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