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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004197`

染色体: Chr01 坐标: 60435082-60442917 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004197`
名称	SmilChr01G004197
描述	uncharacterized SmilChr01G004197
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60435082 - 60442917 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000335`
GeneID	`131000335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000335`
原始查询	`SmilChr01G004197`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816540]; symbol=AT2G20210; hit=AT2G20210; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816540]; symbol=AT2G20210; hit=AT2G20210; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G20210` (AT2G20210) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816540] identity=44.8; qcov=1.01; evalue=4.88e-152; confidence=medium
Rice	`Os12g0228900` - identity=41.9; qcov=0.258; evalue=6.19e-26; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF13516 (LRR_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057782183.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057782183.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057782183.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782183.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782183.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60435688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:60435772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:60436056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B105,B75
`Chr1:60436317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C31
`Chr1:60437670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B80
`Chr1:60437670`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:60440453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B12,B49,B51
`Chr1:60440466`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr1:60441433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,A25,B10,C27,C49
`Chr1:60441819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:60441906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,C70,C76
`Chr1:60442288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782183.1

619 aa

310

619

LRR_6

LRR_1

PF13516 LRR_6 398-412 aa PF00560 LRR_1 399-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782183.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	398	412	4.5e-05	23.9	Leucine Rich repeat
`XP_057782183.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	399	414	6.3e-07	29.0	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926200.1
TTTTTTTGACAATAAGTATGGAGTTAATAGTGTGATTGTGAAATGAAATAACAGAATGATGAGAGTTTTTTACTCCCTCCCTGTTTTATTGCACGTAAAATAAAAAATTGTACTAAAATAGTTAAAAGTGTTAAGATTTATATTTTTTTATATGTTAAATTTTACTCTCTCTGTCCCATTAAATCTAAGATTCTTTTGTCCGACGGTAAGTGAGACTTTTTCCTTTTTTTTCTAATAAAAATTTTACCCTTAAAAAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000335
ATGTCTGGAGTGCCCAAATTAGTTGATTTATGCACGGCCGCCATTGCCGATGAACTTCTCCAAGGGGACGATAACGACGATATCTTTTTGGTTATTTATGAACTGCCGCCGGAATTGTTTGATGGATTGTTGCCGCAGCTGCCTCCATTAGCACTGCACAAGTTGCAAGATAAATTGCCAATCAACTTCATGGAGAGCAAAGAGCATGCTTACGATGATAATAGAGACTGTCGAAAACGTAGAAGATGCGACATTTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782183.1
MSGVPKLVDLCTAAIADELLQGDDNDDIFLVIYELPPELFDGLLPQLPPLALHKLQDKLPINFMESKEHAYDDNRDCRKRRRCDILDSAWRALYKARWPNLSQQKQAVAWFDRNKEKYESVNDWQQKYWEAHLQDCVDAIAETALLPSYDGSIGELQIPGGILEQIGGKDYLIKLSLDSLKFSRHCQQFGVYVRRLRLPNALCAAETCELLQNSKLGSLELQWIKSNDHVEGLCKLLNQSTETLKSIEFIHCKLSPDFVN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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