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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004206`

染色体: Chr01 坐标: 60503173-60504883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004206`
名称	SmilChr01G004206
描述	uncharacterized SmilChr01G004206
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60503173 - 60504883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000399`
GeneID	`131000399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000399`
原始查询	`SmilChr01G004206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os09g0480300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=31.5; qcov=0.719; evalue=5.5e-14; confidence=low
Rice	`Os09g0480300` - identity=34.7; qcov=0.724; evalue=2.43e-25; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782269.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782269.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782269.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782269.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057782269.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60503763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:60503812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C61
`Chr1:60503818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:60503859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B26,B64,C83
`Chr1:60503878`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A19,A23,A3,A5,B108,B120,B122,B124,B128,B138,B15,B22,B27,B35,B44,B5,B54,B56,B57,B63,B67,B74,B77,B83,B96,C16,C19,C26,C36,C37,C45,C5,C52,C53,C54,C63,C7,C70,C76,D7
`Chr1:60503933`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A20,A23,A25,B100,B102,B103,B114,B118,B119,B122,B15,B63,B79,B83,B86,C18,C3,C42,C64,C66,C7,C76,C79,C84
`Chr1:60503947`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	71	A10,A13,A18,A2,A25,A4,A5,A7,A8,A9,B102,B104,B11,B111,B113,B117,B12,B122,B123,B124,B128,B13,B131,B132,B136,B14,B16,B22,B33,B34,B4,B46,B47,B49,B55,B60,B68,B70,B71,B77,B8,B87,B91,B97,B98,B99,C12,C2,C20,C21,C26,C30,C32,C4,C47,C48,C5,C59,C61,C65,C68,C72,C75,C78,C84,C86,C9,D11,D7,D8,D9
`Chr1:60503962`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,D3
`Chr1:60503963`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B53
`Chr1:60503963`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B53
`Chr1:60503999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:60504045`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B29

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782269.1

203 aa

102

203

SWIM

PF04434 SWIM 27-56 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782269.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	27	56	2e-08	34.3	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926286.1
CATCCCTCTATTCAATTAATACAAAAAATCACATTCACTTCCACTTCTCTCTAACCCTAACGAAATTACATTCCCCCATTTTACTTCTACTCATCTCTCATTCTTTCTTTTTCACCCTTTGTTTTTCACTTACAAAAAAATTACTCATCTCGTTGGCAAATGAACGTGCCTTGAACCGCTCAAGTTTGTGTCTTTCTTTGAGTTTTGGTGGTGGTCCAAGACTAGTGTTAGAGGAATGAGCAACAGGTAGGACCCCTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000399
ATGAAGTATAGTAGTGGATATTGTGTTACACATCCTGCATTAGAAGGTAGGTTTGAAGTTGAAAAGCATGAGGATCGTTTTGTTGTTGATATTGTTTCTAGATCTTGCACATGTAGATTGTGGGATATAACAGGGATACCATGTGCACATGCTTGCTCAGCGATATATTTTCTCGAGGACAATGCAGAAAATTATGTGCACGAGTACTTTTTTTTGGAGAGGTATAAACTCTTATATGAATTTGGGTTTCCACCTTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782269.1
MKYSSGYCVTHPALEGRFEVEKHEDRFVVDIVSRSCTCRLWDITGIPCAHACSAIYFLEDNAENYVHEYFFLERYKLLYEFGFPPLNGEKMWPRAEGYDVKPPQRKKMPGRPKKRRIRDPSEPNPSNPNKLRRNGSRMTCQKCFQQGHNSRGCKNTPVDKPPKKKGERGRPRKTQAPQQIVEPSTSNARSTSKGNEAAHQTLV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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