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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004210`

染色体: Chr01 坐标: 60541242-60544237 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004210`
名称	SmilChr01G004210
描述	protein SINE1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60541242 - 60544237 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000439`
GeneID	`131000439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000439`
原始查询	`SmilChr01G004210`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SINE1
产物	protein SINE1
Arabidopsis	`AT1G54385` (AT1G54385) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841880] identity=52.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0580000` - identity=53.4; qcov=0.821; evalue=2.21e-158; confidence=high
GO	GO:0005874 (microtubule); GO:0008017 (microtubule binding)
KEGG	-
Pfam	PF24714 (TOR1L1_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057782331.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.80000	`XP_057782331.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782331.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782331.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782331.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60542726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:60542934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B18
`Chr1:60542999`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C32
`Chr1:60542999`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C32
`Chr1:60543002`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C32
`Chr1:60543002`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C32
`Chr1:60543006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,B18
`Chr1:60543682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr1:60543814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:60543859`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B64,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782331.1

575 aa

288

575

TOR1L1_N

PF24714 TOR1L1_N 18-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782331.1`	Pfam	`PF24714`	TOR1L1_N	Repeat	18	289	5.1e-20	72.7	TORTIFOLIA1 N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926348.1
TTCAAATGAAAAGCATTAAGACAATTGCGCACAAAAAGCGCGTATACTGCTGAAACACTCACCTCTGAATATCGCTTCACTTGAGCCCCGCCGTTAGATCTCCCCCTCCTTCTATCCACCTCAATCATCCATCTGCACTCACACTTCAAGATACGATTTTTCAAGCTCCAAAAGGAGAAATACCGGCTAGGGTCCGGGCATCATATCAAGTAATATGGGAAGAAGTCTAAGCCCAATACTGCGTAGGGAGTTGGAGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000439
ATGGGAAGAAGTCTAAGCCCAATACTGCGTAGGGAGTTGGAGAATCTTGACAAGGATGCTGATAGTAGAAAATCGGCTATGAAAGCATTAAAATTGTATGTGAAAGACTTGGATTCCAAGGCAATCCCCATCTTTCTTGCTCAAGTTTCTGAAACCAAACAAACTGGCATGTCATCTGGCGAGCACACAATTTCGCTATATGAGGTCCTTGCTCGAGTCCATGGACCCAAAATTGTTCCCCAGATTGATAACATCATGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782331.1
MGRSLSPILRRELENLDKDADSRKSAMKALKLYVKDLDSKAIPIFLAQVSETKQTGMSSGEHTISLYEVLARVHGPKIVPQIDNIMNTIVKTLSLSAGAFALHQACSKVVPAIARYAIDPTTAEERKRHVIHSLCKPLSDCLLGSLENLSSGAALCLQSLVESDNWRFASNEMVNEVCQKVAGALEKHSQTNSHMALVTALAKHNSLIVEAYGRLLIQSGLRILDAGSVEENSQKRLSAIHMVSSLLRYLDPKSISSELE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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