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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004225`

染色体: Chr01 坐标: 60618548-60619246 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004225`
名称	SmilChr01G004225
描述	uncharacterized SmilChr01G004225
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60618548 - 60619246 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131010998`
GeneID	`131010998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131010998`
原始查询	`SmilChr01G004225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030]; symbol=AT4G29090; hit=AT4G29090; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G29090` (AT4G29090) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829030] identity=27.7; qcov=0.841; evalue=5.79e-13; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.4; qcov=0.784; evalue=3.55e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131010998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057794715.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057794715.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057794715.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057794715.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794715.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60618557`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	32	A23,B101,B11,B12,B15,B30,B36,B37,B44,B48,B56,B58,B73,B84,B89,B90,B97,C16,C20,C21,C30,C31,C41,C45,C46,C48,C63,C69,C72,C76,C83,D2
`Chr1:60618558`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	31	A23,B101,B11,B12,B15,B30,B36,B37,B44,B48,B56,B58,B73,B84,B89,B90,B97,C16,C20,C21,C30,C31,C41,C45,C46,C63,C69,C72,C76,C83,D2
`Chr1:60618604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:60618619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A11,A19,B112,B125,B13,B130,B25,B80,B89,C86
`Chr1:60618630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:60618763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B4
`Chr1:60618800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B131,C58
`Chr1:60618874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B49,B8,B91,C68
`Chr1:60618875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A6,B137,B31,C52,C75,C79,D9
`Chr1:60618878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr1:60618902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr1:60618905`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	100	A11,A13,A15,A24,A25,A4,A5,B1,B103,B106,B111,B112,B113,B115,B117,B12,B124,B127,B13,B130,B131,B133,B14,B140,B19,B2,B20,B21,B24,B27,B29,B3,B32,B33,B38,B39,B4,B46,B47,B50,B53,B54,B55,B57,B60,B62,B63,B64,B65,B71,B8,B81,B82,B85,B86,B87,B9,B94,B98,C14,C16,C18,C2,C21,C23,C26,C27,C28,C31,C33,C34,C42,C44,C45,C47,C48,C49,C51,C53,C55,C56,C57,C58,C61,C64,C65,C66,C71,C74,C76,C77,C78,C8,C80,C85,C87,D3,D4,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794715.1

232 aa

116

232

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 34-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794715.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	34	128	1.9e-16	61.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938732.1
ATGGAGGCTGTGGCTGAGCTTTCTAACCACATTTCTCAGTTCTCTATTTTTGCTGGGACCGCCGATAAGTGGATTTGGACCGCCTCTGCTGATGGTCGATACACAACAAAGTCAGCGTATCAAATCATCAATCAAGTCACCTCAGAGAGCCCGACACTTGGGGTTGACATTAAGTTACTGAATTCGGTTTGGAGAGCAAAGACACCCCAAAAAACGTCTGCAACGGCATGGAGACTCCTCTTAAACCGACTCCCAACATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131010998
ATGGAGGCTGTGGCTGAGCTTTCTAACCACATTTCTCAGTTCTCTATTTTTGCTGGGACCGCCGATAAGTGGATTTGGACCGCCTCTGCTGATGGTCGATACACAACAAAGTCAGCGTATCAAATCATCAATCAAGTCACCTCAGAGAGCCCGACACTTGGGGTTGACATTAAGTTACTGAATTCGGTTTGGAGAGCAAAGACACCCCAAAAAACGTCTGCAACGGCATGGAGACTCCTCTTAAACCGACTCCCAACATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794715.1
MEAVAELSNHISQFSIFAGTADKWIWTASADGRYTTKSAYQIINQVTSESPTLGVDIKLLNSVWRAKTPQKTSATAWRLLLNRLPTCDNLLRMKILENEDEATCGECHSRGESANHVFLQCSKAEMVWNEIQQWMGFYMARPARIQDFFGMFSSFQNDKKIKSLLLLTWVCTIWILWKKRNEKRFEKKEWDANSVVLEIKIRLWSWNKVFRIVGKELDVQAWCAADLINSLL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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