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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004228`

染色体: Chr01 坐标: 60662891-60664457 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004228`
名称	SmilChr01G004228
描述	uncharacterized SmilChr01G004228
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60662891 - 60664457 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011017`
GeneID	`131011017`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011017`
原始查询	`SmilChr01G004228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03078 (ATHILA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011017

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794738.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794738.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794738.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794738.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60663147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B7,C43,C45
`Chr1:60663147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C43,C45
`Chr1:60663158`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	49	A14,A16,A18,A25,A3,B1,B11,B113,B115,B117,B136,B14,B21,B31,B37,B41,B45,B55,B56,B59,B6,B75,B78,B9,B90,B91,B92,B94,B99,C11,C12,C14,C24,C25,C34,C35,C48,C50,C56,C6,C63,C67,C71,C72,C80,C85,C86,D10,D5
`Chr1:60663159`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B15,B84,C20,C82
`Chr1:60663159`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B15,B84,C20,C82
`Chr1:60663165`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B15,B84,C20,C82
`Chr1:60663165`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B15,B84,C20,C82
`Chr1:60663191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:60663196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B94,D7
`Chr1:60663234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	142	A11,A16,A18,A19,A20,A22,A25,A6,A7,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B115,B118,B120,B123,B125,B13,B130,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B18,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B3,B31,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B49,B5,B51,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B83,B84,B85,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C26,C29,C33,C34,C35,C36,C39,C4,C41,C42,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C59,C6,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C75,C76,C80,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D5,D6,D8
`Chr1:60663246`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	139	A11,A16,A18,A19,A20,A22,A25,A7,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B108,B109,B11,B110,B112,B113,B115,B118,B120,B123,B125,B13,B130,B136,B137,B138,B14,B15,B18,B2,B21,B22,B23,B26,B27,B3,B31,B32,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B45,B49,B5,B51,B56,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B81,B84,B85,B9,B90,B91,B92,B94,B96,B98,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C16,C18,C19,C2,C20,C22,C26,C29,C33,C34,C35,C36,C39,C4,C40,C41,C42,C45,C47,C48,C49,C5,C50,C52,C55,C56,C59,C6,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C75,C76,C80,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D5,D6,D8
`Chr1:60663258`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B101

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794738.1

438 aa

219

438

ATHILA

PF03078 ATHILA 70-249 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794738.1`	Pfam	`PF03078`	ATHILA	Domain	70	249	4.9e-05	23.1	ATHILA ORF-1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938755.1
GCCACCGTTGCCGTCTCCAGAGTCCCTTTCTTTTTTTTAACTCACGGTGTTGTCCCTTTCTCCAAGCCACCGCTGCTATCTCTAGAGTCCGGCAACGGCCAATCTTCTTCGACGCCGGTTTGCACTTCTTCTTCTCCTCTTCCAAGTGGAGAAGATGGCTCGAACGAAAAATGCTCGTGGCCCTAAAACACCAAAGAACTCAACGATCACGCCAGAAGCAATCATTAACAATGCCCACTCTTCTAAACGAACAAGAGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011017
ATGGCTCGAACGAAAAATGCTCGTGGCCCTAAAACACCAAAGAACTCAACGATCACGCCAGAAGCAATCATTAACAATGCCCACTCTTCTAAACGAACAAGAGGTCAGGCTGTGAAAGTATCCCCTGTTAAAAGGTTGGAATGTCTTCCTCCATCTGAGTCAAATATCCAAACCTACTTGAATTTTCCCACCAAACTCTTGAAGGATAGGTATTCAGTAATTTCTCAGTGTGACATTCTTCAAGGTAGAAGTCTCGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794738.1
MARTKNARGPKTPKNSTITPEAIINNAHSSKRTRGQAVKVSPVKRLECLPPSESNIQTYLNFPTKLLKDRYSVISQCDILQGRSLDVSTLETLRIRKEVEDLIEQIGWKSFFHNDCPAFIELTREFYTTFEFDTPADLSLDTPGVIRYRLMGYDIEESITDFNLSLGAISKDDLHVDWYINSKVGYGDFVPNHVWVDMAVGKTTYDPSQSPSTLLKKPEWQYLHRLLSFNYIARKSGTTTCSKVELYVIWAMVNSVKLNL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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