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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004229`

染色体: Chr01 坐标: 60673506-60674711 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004229`
名称	SmilChr01G004229
描述	uncharacterized SmilChr01G004229
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60673506 - 60674711 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011035`
GeneID	`131011035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011035`
原始查询	`SmilChr01G004229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=39.5; qcov=0.998; evalue=1.34e-95; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794760.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794760.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794760.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794760.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60673574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr1:60673590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	B114,B121,B129,B134,B15,B36,B38,B39,B4,B62,B64,B76,B86,B87,C10,C12,C39,C49,C77,C79,C81
`Chr1:60673649`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr1:60673822`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	19	B114,B121,B129,B134,B36,B38,B4,B53,B62,B64,B76,B86,B87,C10,C12,C49,C77,C79,C81
`Chr1:60673824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,C54,C86
`Chr1:60673890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B49
`Chr1:60673900`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B63,B95
`Chr1:60673900`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B63,B95
`Chr1:60673993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:60674095`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B20,B25,C6,C83,D2
`Chr1:60674095`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B20,B25,C6,C83,D2
`Chr1:60674321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794760.1

401 aa

200

401

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 10-83 aa PF02992 Transposase_21 311-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794760.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	10	83	1.9e-24	86.3	Transposase-associated domain
`XP_057794760.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	311	401	2.2e-45	155.2	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938777.1
ATGGAAGGTGTAGAAATTGAAATGGATAAAACTTGGATTATGCTCGATGATAGAAGGCTCACTCAATACGAAGAAGGTGTTCGTCAGTTCTTAGATTTTGCATATTCTTCTAAAGAAAAAGGAGAAACGATTAGATGCCCATGCAAAAAGTGCAATAATGTTTTGTTTCAGAATCGAAATAATGTTGAAGATCATATATTTAAATACGGTTTTATCAAATCGTATGTCATATGGGTTCTTCATGGTGAAGAATATAGTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011035
ATGGAAGGTGTAGAAATTGAAATGGATAAAACTTGGATTATGCTCGATGATAGAAGGCTCACTCAATACGAAGAAGGTGTTCGTCAGTTCTTAGATTTTGCATATTCTTCTAAAGAAAAAGGAGAAACGATTAGATGCCCATGCAAAAAGTGCAATAATGTTTTGTTTCAGAATCGAAATAATGTTGAAGATCATATATTTAAATACGGTTTTATCAAATCGTATGTCATATGGGTTCTTCATGGTGAAGAATATAGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794760.1
MEGVEIEMDKTWIMLDDRRLTQYEEGVRQFLDFAYSSKEKGETIRCPCKKCNNVLFQNRNNVEDHIFKYGFIKSYVIWVLHGEEYSDSDEDGRMADDEFGETIGDMGGQNFVDIQSMLEDVHASTRSTVFAKGSTSDENSMPKFESKTFLKLLKDADKELYPGCKSFSKLSFVVTLMHIKIISRWSNKSFSMLLEVLKKALPDGESLPSSYYEAKTIIQGLGLNYEKVHACVNDCVLFRKKHENDEECPNCLEPRYKFVD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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