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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004246`

染色体: Chr01 坐标: 60765462-60767867 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004246`
名称	SmilChr01G004246
描述	germin-like protein subfamily 1 member 11
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60765462 - 60767867 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000645`
GeneID	`131000645`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000645`
原始查询	`SmilChr01G004246`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	germin-like protein subfamily 1 member 11
产物	germin-like protein subfamily 1 member 11
Arabidopsis	`AT5G39150` (AT5G39150) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833908] identity=44.2; qcov=0.956; evalue=9.91e-56; confidence=medium
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=43.1; qcov=0.952; evalue=3.56e-54; confidence=medium
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000645

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782645.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782645.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782645.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782645.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782645.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60766975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C17,C22,C51,C67,D10
`Chr1:60766983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B51,B82,C10
`Chr1:60766992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B2,B51,B82,C10,C46
`Chr1:60767054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B13,B24
`Chr1:60767064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B53,C34,C5,C63
`Chr1:60767083`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C32
`Chr1:60767083`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C32
`Chr1:60767118`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,B57,C66
`Chr1:60767118`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A11,B57,C66
`Chr1:60767124`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A11,B57,C66
`Chr1:60767124`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A11,B57,C66
`Chr1:60767145`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A11,B140,B57,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782645.1

227 aa

114

227

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 57-205 aa PF07883 Cupin_2 91-165 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782645.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	57	205	4.7e-36	124.3	Cupin
`XP_057782645.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	91	165	5.7e-08	33.1	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926662.1
TACAATTTATACCTTTCGCATTTTCTTCTAATTTTTGTAAGAAACTAATTAAGGCAAACAACACAGCATTCGGCCACCTCAATAAAAACAGGTTGCTCCCACTCTTACGACCTAAAACAAGCAATTAATTCTTTCTCGATTTGCATTGAGTAAGAATTCCAAATGGCTTCAAATGCTATTTTATTAATCACATTAGCCCTCTTGAATTTCATTTGCATCTCCTTCGCCTTCGACCCTCGTCCTCTTCAAGATTTCTGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000645
ATGGCTTCAAATGCTATTTTATTAATCACATTAGCCCTCTTGAATTTCATTTGCATCTCCTTCGCCTTCGACCCTCGTCCTCTTCAAGATTTCTGCGTTGCAGATCCCCCGGGAAACGCAACATGCAAGGACCCAAAAGCAGTCACCGCCAACGACTTCTTTTTGAGCGGTCTTGATCGGCCGGGACCCTTTAATGCGTACGGCGTCGCCTTCGTCCTAGCCTCGGCAAACACGGTGCCGGGGTTCAACACTCTTGGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782645.1
MASNAILLITLALLNFICISFAFDPRPLQDFCVADPPGNATCKDPKAVTANDFFLSGLDRPGPFNAYGVAFVLASANTVPGFNTLGLTLGRAEFAPNGYLPPHIHPTSSEVIYVAEGILEVGFVTTYPQYKYYSKVLNKGDVFIIPVGLLHIQRNVARTKTVILAAFNTQNRRIIYIPDSAFAAKPAINSLYLAAAFKLNENTVKDLQTKQWEGRFYRALLILFKIL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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