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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004255`

染色体: Chr01 坐标: 60831231-60832355 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004255`
名称	SmilChr01G004255
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60831231 - 60832355 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011101`
GeneID	`131011101`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011101`
原始查询	`SmilChr01G004255`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
产物	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=46.5; qcov=0.376; evalue=3.21e-21; confidence=low
Rice	`Os01g0802400` - identity=48.8; qcov=0.376; evalue=1.74e-23; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011101

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794858.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794858.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794858.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794858.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794858.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60831251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,C2,C32,C68
`Chr1:60831271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,C11,C14,C83
`Chr1:60831291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B66
`Chr1:60831292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B64
`Chr1:60831293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B48,C19,C46
`Chr1:60831304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B88
`Chr1:60831321`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B31,C11,C83
`Chr1:60831321`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B31,C11,C83
`Chr1:60831346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C68
`Chr1:60831348`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	20	A7,B111,B113,B26,B49,B57,B62,B67,B69,B90,B94,C15,C26,C33,C37,C53,C70,C71,C77,C79
`Chr1:60831352`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A7,B111,B113,B26,B49,B57,B62,B67,B69,B90,B94,C15,C26,C33,C37,C53,C70,C71,C77,C79
`Chr1:60831364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794858.1

229 aa

114

229

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 109-190 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794858.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	109	190	1.1e-26	93.1	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938875.1
ATGTCTAGCAATGATGAGTACAATGATGAAAATACTTACACGACATATACAAGTGATATGCCGAGTACTGGTACGCCTGCTGCCCCTGCTGCCCAGCCTGCCCTTGCTGCCACAACTGCAGAAACTGGTTTGGGAACGTCCAATCCCACAACTAAGCCCCCAATGAACAAAAGAAAACAAAGGTCAGCTGCTTGGGATCACTTTAAAGTTACTGTTAGTGCATCAAATGATCCAAGCTGTGGATTCACAAATGAAGAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011101
ATGTCTAGCAATGATGAGTACAATGATGAAAATACTTACACGACATATACAAGTGATATGCCGAGTACTGGTACGCCTGCTGCCCCTGCTGCCCAGCCTGCCCTTGCTGCCACAACTGCAGAAACTGGTTTGGGAACGTCCAATCCCACAACTAAGCCCCCAATGAACAAAAGAAAACAAAGGTCAGCTGCTTGGGATCACTTTAAAGTTACTGTTAGTGCATCAAATGATCCAAGCTGTGGATTCACAAATGAAGAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794858.1
MSSNDEYNDENTYTTYTSDMPSTGTPAAPAAQPALAATTAETGLGTSNPTTKPPMNKRKQRSAAWDHFKVTVSASNDPSCGFTNEESKAVVEEFSALDEFGLSEQKSQLELYMQEARLDAKSNLDVLGFWKGNQYKHPQVAHMARDILSIPITTVASEAVFSVGGRVLDQYRSSLKASTVEAIICTRDWLFGEKAFKSETPTSELAEDFIHGDDEPQTESSSVSTIVVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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