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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004259`

染色体: Chr01 坐标: 60854805-60856481 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004259`
名称	SmilChr01G004259
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60854805 - 60856481 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000725`
GeneID	`131000725`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000725`
原始查询	`SmilChr01G004259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G38910` (AT5G38910) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833883] identity=43.8; qcov=1.03; evalue=9.9e-53; confidence=medium
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=41.7; qcov=1.01; evalue=3.05e-57; confidence=medium
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000725

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782754.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782754.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782754.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782754.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782754.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60855648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C18,C66
`Chr1:60855945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782754.1

214 aa

107

214

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 61-206 aa PF07883 Cupin_2 92-162 aa

XP_057782763.1

213 aa

106

213

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 60-205 aa PF07883 Cupin_2 91-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782754.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	61	206	1.8e-35	122.5	Cupin
`XP_057782754.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	92	162	5.4e-10	39.5	Cupin domain
`XP_057782763.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	60	205	1.5e-35	122.7	Cupin
`XP_057782763.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	91	161	5.4e-10	39.6	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926771.1
TGTCGACATGGTGGGAAGCGCATTATAAGCCACTCGGATAAAGTGAACTTAGTGCTTCAAATAACCATCATGTTCTTCATTACTGCTTCATTCCATAATTTTTCTTTATTAATAGGCTAACCCATTCTCATAATTTTCTAAAATTTATTTAATTCCGCGATAGCAATGGAAACTTTGTTGTTGGGAAAACGATCAAGCTGTCGGGGCGACGTAGTGTTGCGGAAGGAGAACTGATAGGCATAAAGGAAGCCCTCTCATGG...

XM_057926780.1
AACACCTCTATAAAAACAGGCTGCAGCTTCCACTCTATAAAACAATTAAGCTTTCTTGATTTGCACATTCAGTAATAAAATAGAAACATATATTGAGGATTCCCAATGGCTTCAACTGCTATTTTATTCATCACATTAGCCCTCTTCAATTCCATTTGCATCTCCTTGGGCTTCGACACTAGTCCTCTCCTAGATTTCTGCGTTGCAGATTCCACAGGAAAAGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCGAACGATTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131000725
ATGGCTTCAACTGCTATTTTATTCATCACATTAGCCCTCTTCAATTCCATTTGCATCTCCTTGGGCTTCGACACTAGTCCTCTCCTAGATTTCTGCGTTGCAGATTCCACAGGAAAAGCAGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCGAACGATTTCTTCCTTGGCGGTCCGCACCTGCCCGCAAACACCTCTAACCCGAACGGCGTCTCCATCAATTTTGCGGGCGCGGCCACGGTGCCGGGGTTCAATACTCTCGG...

LOC131000725
ATGGCTTCAACTGCTATTTTATTCATCACATTAGCCCTCTTCAATTCCATTTGCATCTCCTTGGGCTTCGACACTAGTCCTCTCCTAGATTTCTGCGTTGCAGATTCCACAGGAAAAGCATGCAAGGACCCAAAAACAGTTACCGCGAACGATTTCTTCCTTGGCGGTCCGCACCTGCCCGCAAACACCTCTAACCCGAACGGCGTCTCCATCAATTTTGCGGGCGCGGCCACGGTGCCGGGGTTCAATACTCTCGGCCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057782754.1
MASTAILFITLALFNSICISLGFDTSPLLDFCVADSTGKAACKDPKTVTANDFFLGGPHLPANTSNPNGVSINFAGAATVPGFNTLGLTLGRVEFARNGYLPPHIHPRASEVIYVVEGAVEAGFITSSPEYKYYTKILKTGDVYIVPIGLVHHVRNVAKGKSVVTATFNSQSPGFISLPNNIFAAKPPVDTNFLAATFKLDEKTVKDLQTKSWL

XP_057782763.1
MASTAILFITLALFNSICISLGFDTSPLLDFCVADSTGKACKDPKTVTANDFFLGGPHLPANTSNPNGVSINFAGAATVPGFNTLGLTLGRVEFARNGYLPPHIHPRASEVIYVVEGAVEAGFITSSPEYKYYTKILKTGDVYIVPIGLVHHVRNVAKGKSVVTATFNSQSPGFISLPNNIFAAKPPVDTNFLAATFKLDEKTVKDLQTKSWL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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