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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004262`

染色体: Chr01 坐标: 60893606-60895376 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004262`
名称	SmilChr01G004262
描述	putative germin-like protein 2-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60893606 - 60895376 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000797`
GeneID	`131000797`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000797`
原始查询	`SmilChr01G004262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative germin-like protein 2-1
产物	putative germin-like protein 2-1
Arabidopsis	`AT5G38960` (AT5G38960) RmlC-like cupins superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833888] identity=48.7; qcov=0.943; evalue=7.11e-59; confidence=high
Rice	`Os02g0491600` (OsGLP2-1) - identity=53.3; qcov=0.934; evalue=2.47e-71; confidence=high
GO	GO:0005618 (cell wall); GO:0030145 (manganese ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00190 (Cupin_1); PF07883 (Cupin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000797

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057782862.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057782862.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057782862.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057782862.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057782862.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60894796`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C37
`Chr1:60894796`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C37
`Chr1:60894849`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B128
`Chr1:60894849`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B128
`Chr1:60894960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C76
`Chr1:60895013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B109,B130,B36,D11
`Chr1:60895019`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B82,C33,C48
`Chr1:60895019`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B82,C33,C48
`Chr1:60895093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C76
`Chr1:60895133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A13,C76
`Chr1:60895133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C76
`Chr1:60895213`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057782862.1

211 aa

106

211

Cupin_1

Cupin_2

PF00190 Cupin_1 57-204 aa PF07883 Cupin_2 91-164 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057782862.1`	Pfam	`PF00190`	Cupin_1	Domain	57	204	3.9e-41	140.8	Cupin
`XP_057782862.1`	Pfam	`PF07883`	Cupin_2	Domain	91	164	2.7e-09	37.3	Cupin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057926879.1
CTAGGGCATCAATCTATAACACAACAGTTTGTAGAAACTACTGATCATATATATAGATTCATAGGATTAATATCAGTTGTATACAAAATAAGTTGTTTTTTCGTACAATCCGAAACAAATAACTTCTTTTGTAATATTTAAAAATGACTTTGAGAAGTATCTTACTCTCTGCTTTTGGCCTCATCAATTTTATGCGCCCCACCTTCGCATTTGATACCAGTCCTTTGCAAGATTTCTGCGTTGCAGATGCCACGACCAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000797
ATGACTTTGAGAAGTATCTTACTCTCTGCTTTTGGCCTCATCAATTTTATGCGCCCCACCTTCGCATTTGATACCAGTCCTTTGCAAGATTTCTGCGTTGCAGATGCCACGACCAAAGCATGCAAGGAGGCTGCAAAAGTTACATCAAACGACTTCTTCTTCAGTGGGCTGCATTTGGCCGGCAACACCTCAAACCCATACGGCGTCGCTGTGGCGACCGTCTCCGCCGCCCAAATTCCAGGGCTCAACAATCTGGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057782862.1
MTLRSILLSAFGLINFMRPTFAFDTSPLQDFCVADATTKACKEAAKVTSNDFFFSGLHLAGNTSNPYGVAVATVSAAQIPGLNNLGMTLMRVDMAANGFFPPHIHPRATELVTVLEGSMEVGFITSYPDYNYFTKILQKGDVFVVPVGLVHNVQNLAKGNTVAMVAFNSQNPGITNFPNAVFEAKPAVDTDYLARSFRLDKKTIEDLKKKF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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