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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004274`

染色体: Chr01 坐标: 60979037-60979825 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004274`
名称	SmilChr01G004274
描述	VQ motif-containing protein 25-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60979037 - 60979825 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000913`
GeneID	`131000913`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000913`
原始查询	`SmilChr01G004274`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 25-like
产物	VQ motif-containing protein 25-like
Arabidopsis	`AT3G58000` (AT3G58000) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824969] identity=43.6; qcov=0.974; evalue=5.01e-28; confidence=medium
Rice	`Os04g0665900` (OsVQ17) - identity=63.6; qcov=0.288; evalue=3.64e-13; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000913

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783046.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057783046.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783046.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783046.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783046.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60979288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:60979331`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:60979392`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B129,B14,B40,B72,B83,B89,C13,C73,D11
`Chr1:60979433`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B44
`Chr1:60979433`	`A`	`ACG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B44
`Chr1:60979483`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	186	A1,A11,A13,A18,A19,A2,A21,A23,A25,A3,A4,A5,A6,A7,A9,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B118,B12,B122,B123,B124,B126,B127,B129,B13,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B36,B4,B40,B41,B42,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B50,B51,B52,B57,B58,B59,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B76,B77,B79,B8,B80,B83,B84,B86,B87,B89,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C2,C20,C21,C22,C23,C25,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C59,C6,C60,C62,C63,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C79,C8,C80,C82,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr1:60979502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B29,C79,C87
`Chr1:60979543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:60979604`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C25,C59
`Chr1:60979616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783046.1

153 aa

153

PF05678 VQ 38-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783046.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	38	64	3.4e-13	49.5	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927063.1
CAAGTTTATACATTTCCCACTTATATAAATAAACACCCCAACTCGTATTCTTTTCAAACAATCACACCAACTCTCCTCAAAATCAAAATTCTCCCCTATCAGAAAACTTCAATTCCCAACAACATGACAATGGAAAATCAGATCTACTGCCCAAAAACAGCCTCATCAAACCTATCCATGCACAGAAACTCGCAAACGATTTCAAAAACGAAGCCCAAAATCCGAATAATCCACATATTTGCACCAGAGATAATCAAGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000913
ATGACAATGGAAAATCAGATCTACTGCCCAAAAACAGCCTCATCAAACCTATCCATGCACAGAAACTCGCAAACGATTTCAAAAACGAAGCCCAAAATCCGAATAATCCACATATTTGCACCAGAGATAATCAAGACTGATGCTGCAAACTTCAGGGAGCTGGTGCAGAGGCTCACCGGCAAGCCTGATCCCAACCTCGACGACGGCAATGAGAGGCTAGTGTTGAGAAAGAAAGAGGCAAGAATTTTGTCTTCAAGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783046.1
MTMENQIYCPKTASSNLSMHRNSQTISKTKPKIRIIHIFAPEIIKTDAANFRELVQRLTGKPDPNLDDGNERLVLRKKEARILSSSKKMGFRERLMKEEGEEIWMSANSGGGFLGGFGEIDHGFLHELNHFQFLEATTAQMQDVYGDHQCQLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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