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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004275`

染色体: Chr01 坐标: 60984478-60984915 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004275`
名称	SmilChr01G004275
描述	VQ motif-containing protein 25-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	60984478 - 60984915 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131011116`
GeneID	`131011116`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131011116`
原始查询	`SmilChr01G004275`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 25-like
产物	VQ motif-containing protein 25-like
Arabidopsis	`AT3G58000` (AT3G58000) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824969] identity=47.1; qcov=0.966; evalue=8.47e-31; confidence=medium
Rice	`Os04g0665900` (OsVQ17) - identity=65.2; qcov=0.317; evalue=2e-14; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131011116

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057794883.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057794883.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057794883.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057794883.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057794883.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:60984631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,C49,C59,C6
`Chr1:60984642`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	B118,B72,B80,B87,B97,C27,C28,D11
`Chr1:60984670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:60984763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,C49,C59,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057794883.1

145 aa

145

PF05678 VQ 20-46 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057794883.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	20	46	6.7e-13	48.6	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057938900.1
ATGCACAGAAATTCCCAAACTATAGCAAAAACGAAGCCAAAAATTCGAATAATCCACATTTTCGCACCGGAAATCATCAAAACCGACGCAACAAACTTCAGGGAGCTCGTTCAAAGGCTCACGGGCAAGCCCACGGCGGCTGATCTGAGCAGCCGCGGCGGCACGAAAAAGGCCAAGCCAAGAAAGAAAGAGGCAAGAATCTTTCCTTCGAGCAAGAAAATGGAGATGGCTATGAGGGCTGGATTCCATGCAGGCTTGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131011116
ATGCACAGAAATTCCCAAACTATAGCAAAAACGAAGCCAAAAATTCGAATAATCCACATTTTCGCACCGGAAATCATCAAAACCGACGCAACAAACTTCAGGGAGCTCGTTCAAAGGCTCACGGGCAAGCCCACGGCGGCTGATCTGAGCAGCCGCGGCGGCACGAAAAAGGCCAAGCCAAGAAAGAAAGAGGCAAGAATCTTTCCTTCGAGCAAGAAAATGGAGATGGCTATGAGGGCTGGATTCCATGCAGGCTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057794883.1
MHRNSQTIAKTKPKIRIIHIFAPEIIKTDATNFRELVQRLTGKPTAADLSSRGGTKKAKPRKKEARIFPSSKKMEMAMRAGFHAGLRERERIKGEEEIWSSANSGGGFLGGFADFDGFMQEINHFPFLEGTTSQSMDVNGLSQLA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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