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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004279`

染色体: Chr01 坐标: 61009073-61011942 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004279`
名称	SmilChr01G004279
描述	non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	61009073 - 61011942 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131000982`
GeneID	`131000982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131000982`
原始查询	`SmilChr01G004279`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A-like
产物	non-structural maintenance of chromosomes element 4 homolog A-like
Arabidopsis	`AT1G51130` (AT1G51130) Nse4, component of Smc5/6 DNA repair complex [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841536] identity=51.3; qcov=0.924; evalue=1.57e-123; confidence=high
Rice	`Os06g0618000` - identity=50.5; qcov=0.872; evalue=2.75e-118; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006281 (DNA repair); GO:0030915 (Smc5-Smc6 complex)
KEGG	-
Pfam	PF08743 (Nse4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131000982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057783121.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057783121.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057783121.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057783121.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057783121.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:61009407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr1:61009412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D11
`Chr1:61009427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,C6
`Chr1:61009465`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:61009837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:61009990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B103,B136,B80,C30
`Chr1:61010702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B22,B41
`Chr1:61011567`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	181	A1,A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,B1,B10,B100,B102,B104,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B114,B115,B117,B118,B120,B121,B126,B127,B13,B131,B133,B134,B135,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B76,B78,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,C10,C11,C12,C13,C16,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C38,C39,C40,C42,C44,C45,C47,C5,C50,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C6,C60,C62,C64,C66,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D2,D3,D6,D7,D8,D9
`Chr1:61011583`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	161	A11,A13,A20,A22,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,B100,B101,B103,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B112,B113,B114,B119,B12,B121,B122,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B21,B22,B24,B25,B28,B29,B3,B30,B31,B33,B34,B38,B39,B4,B40,B41,B47,B48,B49,B51,B53,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B62,B64,B66,B67,B68,B70,B71,B72,B75,B76,B77,B79,B81,B82,B85,B87,B88,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C14,C15,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C26,C27,C3,C31,C33,C34,C36,C37,C41,C42,C43,C46,C48,C49,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C70,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C84,C85,C87,D10,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr1:61011620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B35
`Chr1:61011655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B25,C11,C69,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057783121.1

382 aa

191

382

Nse4_C

PF08743 Nse4_C 230-316 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057783121.1`	Pfam	`PF08743`	Nse4_C	Domain	230	316	4e-24	85.4	Nse4 C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057927138.1
AAACTAGAGAGAGAGAGAGAGCGTGTGCTCGAAGACTCGAAAATTTCAAACCACTTAAGAGAGAGAGAGAGAGCGTCCGCTCAAATATTTCAAACCAAATAAATACTACCTCCCTTTCCTTTCGGTTCCCTCTGCTTTTCGAATTACCCAATTCCCTCACTATTTTGCCCTATTCTCGCTCCCCCCAAAAAGTAAAGAATTTAGGAACTCAATTCTCAGTTATCCCATTTCCCAGCCCTAATTTTATGCACTATTGAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131000982
ATGCGAACCGTAAAGAGGGAGATAACTAATCGTAACAGTCGGATTACACGGAGAAGTGAGCAGAATGTCAGTGAAGCACAAGGTGCAAGCGTGACAGCGGAAGCTGAGGATGCTGTTTTCGAGCGCAGGGTTCTTCGGTCCAAGTACTTCAGTTTCAAGAACCGAATATGCGATGAGAGGGATGATTTATCAAAAGTTGATTCTAACAAGTTCAAATCATTTATTGAAGAAGTGGATACCCTGCATCAGCTAGTACAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057783121.1
MRTVKREITNRNSRITRRSEQNVSEAQGASGXTAEAEDAVFERRVLRSKYFSFKNRICDERDDLSKVDSNKFKSFIEEVDTLHQLVQKPREQVADAEALFDITNTLVTSVKAYNSDGLTPSDFVSCLLREFGQEGGPSSNQNEQRSSIRWEDIGQVVSVVFRSAPGCRTMVGPMNTELKQRKTVVYRKRPKPTKNSRPEELDETDGDDKTDTDKNMATMFNILRKNRKAKLENLILNRKSFAQTVENLFALSFLIKDGRA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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